Protein–RNA interactions for Protein: P29374

ARID4A, AT-rich interactive domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID4AP29374 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARID4AP29374 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARID4AP29374 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ARID4AP29374 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARID4AP29374 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARID4AP29374 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARID4AP29374 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ARID4AP29374 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARID4AP29374 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARID4AP29374 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARID4AP29374 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARID4AP29374 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARID4AP29374 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARID4AP29374 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARID4AP29374 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ARID4AP29374 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARID4AP29374 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARID4AP29374 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARID4AP29374 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARID4AP29374 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARID4AP29374 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARID4AP29374 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARID4AP29374 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARID4AP29374 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARID4AP29374 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARID4AP29374 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARID4AP29374 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARID4AP29374 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARID4AP29374 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARID4AP29374 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ARID4AP29374 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARID4AP29374 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARID4AP29374 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARID4AP29374 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARID4AP29374 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARID4AP29374 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARID4AP29374 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ARID4AP29374 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ARID4AP29374 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARID4AP29374 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARID4AP29374 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARID4AP29374 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARID4AP29374 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARID4AP29374 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARID4AP29374 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARID4AP29374 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ARID4AP29374 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARID4AP29374 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARID4AP29374 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARID4AP29374 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARID4AP29374 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARID4AP29374 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARID4AP29374 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ARID4AP29374 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ARID4AP29374 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARID4AP29374 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ARID4AP29374 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARID4AP29374 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARID4AP29374 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARID4AP29374 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARID4AP29374 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARID4AP29374 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARID4AP29374 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARID4AP29374 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARID4AP29374 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARID4AP29374 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARID4AP29374 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARID4AP29374 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARID4AP29374 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARID4AP29374 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ARID4AP29374 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARID4AP29374 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARID4AP29374 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARID4AP29374 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARID4AP29374 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARID4AP29374 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARID4AP29374 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARID4AP29374 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARID4AP29374 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ARID4AP29374 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
ARID4AP29374 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ARID4AP29374 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ARID4AP29374 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ARID4AP29374 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ARID4AP29374 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ARID4AP29374 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
ARID4AP29374 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARID4AP29374 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARID4AP29374 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARID4AP29374 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARID4AP29374 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARID4AP29374 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARID4AP29374 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARID4AP29374 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARID4AP29374 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARID4AP29374 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARID4AP29374 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARID4AP29374 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARID4AP29374 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARID4AP29374 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms