Protein–RNA interactions for Protein: P28074

PSMB5, Proteasome subunit beta type-5, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB5P28074 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
PSMB5P28074 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PSMB5P28074 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PSMB5P28074 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PSMB5P28074 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PSMB5P28074 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
PSMB5P28074 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PSMB5P28074 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PSMB5P28074 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PSMB5P28074 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PSMB5P28074 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PSMB5P28074 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PSMB5P28074 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PSMB5P28074 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PSMB5P28074 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PSMB5P28074 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PSMB5P28074 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PSMB5P28074 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PSMB5P28074 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PSMB5P28074 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PSMB5P28074 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PSMB5P28074 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PSMB5P28074 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PSMB5P28074 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PSMB5P28074 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PSMB5P28074 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PSMB5P28074 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PSMB5P28074 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PSMB5P28074 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PSMB5P28074 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PSMB5P28074 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PSMB5P28074 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PSMB5P28074 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PSMB5P28074 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PSMB5P28074 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PSMB5P28074 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PSMB5P28074 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PSMB5P28074 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PSMB5P28074 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PSMB5P28074 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PSMB5P28074 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PSMB5P28074 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PSMB5P28074 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PSMB5P28074 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PSMB5P28074 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PSMB5P28074 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PSMB5P28074 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PSMB5P28074 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PSMB5P28074 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PSMB5P28074 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PSMB5P28074 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PSMB5P28074 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PSMB5P28074 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PSMB5P28074 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PSMB5P28074 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PSMB5P28074 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PSMB5P28074 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PSMB5P28074 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PSMB5P28074 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PSMB5P28074 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PSMB5P28074 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PSMB5P28074 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PSMB5P28074 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PSMB5P28074 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PSMB5P28074 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PSMB5P28074 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PSMB5P28074 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PSMB5P28074 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PSMB5P28074 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PSMB5P28074 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PSMB5P28074 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PSMB5P28074 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PSMB5P28074 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PSMB5P28074 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PSMB5P28074 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
PSMB5P28074 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PSMB5P28074 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PSMB5P28074 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PSMB5P28074 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PSMB5P28074 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PSMB5P28074 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PSMB5P28074 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PSMB5P28074 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PSMB5P28074 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PSMB5P28074 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PSMB5P28074 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PSMB5P28074 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PSMB5P28074 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PSMB5P28074 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PSMB5P28074 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PSMB5P28074 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PSMB5P28074 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PSMB5P28074 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PSMB5P28074 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PSMB5P28074 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PSMB5P28074 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PSMB5P28074 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PSMB5P28074 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PSMB5P28074 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PSMB5P28074 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms