Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PSMB4P28070 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PSMB4P28070 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PSMB4P28070 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PSMB4P28070 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PSMB4P28070 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PSMB4P28070 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PSMB4P28070 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PSMB4P28070 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PSMB4P28070 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PSMB4P28070 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
PSMB4P28070 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PSMB4P28070 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PSMB4P28070 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PSMB4P28070 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PSMB4P28070 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PSMB4P28070 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PSMB4P28070 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PSMB4P28070 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PSMB4P28070 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PSMB4P28070 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PSMB4P28070 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PSMB4P28070 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PSMB4P28070 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PSMB4P28070 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PSMB4P28070 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PSMB4P28070 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PSMB4P28070 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PSMB4P28070 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
PSMB4P28070 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
PSMB4P28070 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
PSMB4P28070 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
PSMB4P28070 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PSMB4P28070 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PSMB4P28070 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PSMB4P28070 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PSMB4P28070 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
PSMB4P28070 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PSMB4P28070 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PSMB4P28070 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PSMB4P28070 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PSMB4P28070 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PSMB4P28070 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PSMB4P28070 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PSMB4P28070 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PSMB4P28070 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PSMB4P28070 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PSMB4P28070 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PSMB4P28070 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
PSMB4P28070 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PSMB4P28070 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PSMB4P28070 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
PSMB4P28070 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PSMB4P28070 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PSMB4P28070 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PSMB4P28070 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PSMB4P28070 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PSMB4P28070 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PSMB4P28070 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PSMB4P28070 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PSMB4P28070 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PSMB4P28070 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PSMB4P28070 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PSMB4P28070 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PSMB4P28070 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PSMB4P28070 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
PSMB4P28070 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PSMB4P28070 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PSMB4P28070 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PSMB4P28070 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PSMB4P28070 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PSMB4P28070 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PSMB4P28070 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PSMB4P28070 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PSMB4P28070 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PSMB4P28070 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PSMB4P28070 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PSMB4P28070 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PSMB4P28070 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PSMB4P28070 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PSMB4P28070 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PSMB4P28070 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PSMB4P28070 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PSMB4P28070 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PSMB4P28070 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PSMB4P28070 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
PSMB4P28070 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
PSMB4P28070 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PSMB4P28070 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PSMB4P28070 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PSMB4P28070 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PSMB4P28070 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PSMB4P28070 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PSMB4P28070 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PSMB4P28070 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PSMB4P28070 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PSMB4P28070 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PSMB4P28070 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
PSMB4P28070 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
PSMB4P28070 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms