Protein–RNA interactions for Protein: P26358

DNMT1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT1P26358 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
DNMT1P26358 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
DNMT1P26358 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
DNMT1P26358 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
DNMT1P26358 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
DNMT1P26358 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
DNMT1P26358 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
DNMT1P26358 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
DNMT1P26358 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
DNMT1P26358 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
DNMT1P26358 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
DNMT1P26358 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
DNMT1P26358 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
DNMT1P26358 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
DNMT1P26358 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
DNMT1P26358 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
DNMT1P26358 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
DNMT1P26358 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
DNMT1P26358 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
DNMT1P26358 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
DNMT1P26358 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
DNMT1P26358 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
DNMT1P26358 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
DNMT1P26358 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
DNMT1P26358 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
DNMT1P26358 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
DNMT1P26358 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
DNMT1P26358 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
DNMT1P26358 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
DNMT1P26358 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
DNMT1P26358 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
DNMT1P26358 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
DNMT1P26358 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC27.31■■□□□ 1.96
DNMT1P26358 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
DNMT1P26358 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
DNMT1P26358 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
DNMT1P26358 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
DNMT1P26358 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
DNMT1P26358 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
DNMT1P26358 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
DNMT1P26358 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
DNMT1P26358 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC27.31■■□□□ 1.96
DNMT1P26358 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
DNMT1P26358 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
DNMT1P26358 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
DNMT1P26358 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
DNMT1P26358 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
DNMT1P26358 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
DNMT1P26358 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
DNMT1P26358 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
DNMT1P26358 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
DNMT1P26358 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
DNMT1P26358 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
DNMT1P26358 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
DNMT1P26358 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
DNMT1P26358 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
DNMT1P26358 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
DNMT1P26358 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
DNMT1P26358 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
DNMT1P26358 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
DNMT1P26358 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
DNMT1P26358 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
DNMT1P26358 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
DNMT1P26358 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
DNMT1P26358 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
DNMT1P26358 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
DNMT1P26358 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
DNMT1P26358 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
DNMT1P26358 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
DNMT1P26358 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
DNMT1P26358 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
DNMT1P26358 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
DNMT1P26358 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
DNMT1P26358 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
DNMT1P26358 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
DNMT1P26358 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
DNMT1P26358 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
DNMT1P26358 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
DNMT1P26358 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
DNMT1P26358 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
DNMT1P26358 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
DNMT1P26358 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
DNMT1P26358 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
DNMT1P26358 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
DNMT1P26358 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
DNMT1P26358 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
DNMT1P26358 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
DNMT1P26358 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
DNMT1P26358 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
DNMT1P26358 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
DNMT1P26358 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
DNMT1P26358 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
DNMT1P26358 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC27.28■■□□□ 1.96
DNMT1P26358 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
DNMT1P26358 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
DNMT1P26358 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
DNMT1P26358 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
DNMT1P26358 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
DNMT1P26358 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
DNMT1P26358 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms