Protein–RNA interactions for Protein: P25774

CTSS, Cathepsin S, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSSP25774 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTSSP25774 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTSSP25774 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CTSSP25774 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CTSSP25774 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTSSP25774 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTSSP25774 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTSSP25774 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTSSP25774 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTSSP25774 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTSSP25774 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTSSP25774 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTSSP25774 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTSSP25774 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTSSP25774 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTSSP25774 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CTSSP25774 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
CTSSP25774 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
CTSSP25774 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
CTSSP25774 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTSSP25774 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTSSP25774 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTSSP25774 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTSSP25774 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTSSP25774 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTSSP25774 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTSSP25774 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTSSP25774 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTSSP25774 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTSSP25774 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTSSP25774 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTSSP25774 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTSSP25774 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTSSP25774 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTSSP25774 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTSSP25774 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTSSP25774 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTSSP25774 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTSSP25774 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTSSP25774 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTSSP25774 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTSSP25774 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTSSP25774 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CTSSP25774 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTSSP25774 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTSSP25774 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTSSP25774 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTSSP25774 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTSSP25774 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTSSP25774 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CTSSP25774 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTSSP25774 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTSSP25774 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTSSP25774 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTSSP25774 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTSSP25774 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CTSSP25774 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTSSP25774 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTSSP25774 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTSSP25774 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTSSP25774 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTSSP25774 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTSSP25774 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTSSP25774 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTSSP25774 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTSSP25774 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTSSP25774 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTSSP25774 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTSSP25774 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTSSP25774 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CTSSP25774 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CTSSP25774 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTSSP25774 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CTSSP25774 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTSSP25774 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTSSP25774 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTSSP25774 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTSSP25774 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CTSSP25774 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTSSP25774 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTSSP25774 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTSSP25774 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTSSP25774 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTSSP25774 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTSSP25774 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTSSP25774 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTSSP25774 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTSSP25774 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTSSP25774 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CTSSP25774 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CTSSP25774 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CTSSP25774 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTSSP25774 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CTSSP25774 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTSSP25774 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CTSSP25774 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTSSP25774 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CTSSP25774 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CTSSP25774 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CTSSP25774 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms