Protein–RNA interactions for Protein: P25054

APC, Adenomatous polyposis coli protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,843 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APCP25054 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APCP25054 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
APCP25054 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APCP25054 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APCP25054 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APCP25054 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APCP25054 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APCP25054 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APCP25054 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APCP25054 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APCP25054 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APCP25054 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APCP25054 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APCP25054 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APCP25054 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APCP25054 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APCP25054 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APCP25054 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APCP25054 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APCP25054 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APCP25054 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APCP25054 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APCP25054 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APCP25054 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APCP25054 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
APCP25054 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APCP25054 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APCP25054 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APCP25054 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APCP25054 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APCP25054 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
APCP25054 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APCP25054 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APCP25054 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APCP25054 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
APCP25054 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APCP25054 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APCP25054 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
APCP25054 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APCP25054 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APCP25054 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APCP25054 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APCP25054 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APCP25054 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
APCP25054 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APCP25054 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
APCP25054 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
APCP25054 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APCP25054 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APCP25054 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APCP25054 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APCP25054 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APCP25054 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APCP25054 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APCP25054 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APCP25054 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APCP25054 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APCP25054 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APCP25054 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APCP25054 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
APCP25054 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APCP25054 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APCP25054 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APCP25054 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APCP25054 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APCP25054 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APCP25054 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APCP25054 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APCP25054 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APCP25054 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APCP25054 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APCP25054 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APCP25054 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APCP25054 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APCP25054 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APCP25054 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APCP25054 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APCP25054 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APCP25054 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APCP25054 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
APCP25054 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
APCP25054 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APCP25054 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APCP25054 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APCP25054 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APCP25054 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APCP25054 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APCP25054 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APCP25054 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APCP25054 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APCP25054 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APCP25054 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APCP25054 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APCP25054 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APCP25054 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
APCP25054 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APCP25054 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APCP25054 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APCP25054 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
APCP25054 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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