Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLR2AP24928 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
POLR2AP24928 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
POLR2AP24928 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR2AP24928 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR2AP24928 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR2AP24928 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR2AP24928 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR2AP24928 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR2AP24928 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR2AP24928 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR2AP24928 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR2AP24928 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR2AP24928 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR2AP24928 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR2AP24928 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR2AP24928 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR2AP24928 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR2AP24928 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR2AP24928 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR2AP24928 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR2AP24928 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
POLR2AP24928 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.03
POLR2AP24928 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLR2AP24928 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLR2AP24928 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
POLR2AP24928 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLR2AP24928 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLR2AP24928 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLR2AP24928 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLR2AP24928 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLR2AP24928 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLR2AP24928 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLR2AP24928 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLR2AP24928 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLR2AP24928 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLR2AP24928 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLR2AP24928 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLR2AP24928 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
POLR2AP24928 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLR2AP24928 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLR2AP24928 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
POLR2AP24928 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLR2AP24928 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLR2AP24928 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLR2AP24928 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLR2AP24928 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLR2AP24928 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
POLR2AP24928 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLR2AP24928 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLR2AP24928 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLR2AP24928 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLR2AP24928 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLR2AP24928 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLR2AP24928 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLR2AP24928 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLR2AP24928 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLR2AP24928 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLR2AP24928 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
POLR2AP24928 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLR2AP24928 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLR2AP24928 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
POLR2AP24928 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLR2AP24928 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLR2AP24928 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLR2AP24928 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLR2AP24928 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLR2AP24928 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
POLR2AP24928 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR2AP24928 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR2AP24928 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR2AP24928 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR2AP24928 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR2AP24928 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR2AP24928 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR2AP24928 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR2AP24928 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR2AP24928 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR2AP24928 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR2AP24928 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR2AP24928 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR2AP24928 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR2AP24928 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR2AP24928 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR2AP24928 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR2AP24928 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR2AP24928 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR2AP24928 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR2AP24928 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR2AP24928 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR2AP24928 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR2AP24928 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR2AP24928 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR2AP24928 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR2AP24928 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
POLR2AP24928 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR2AP24928 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR2AP24928 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR2AP24928 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
POLR2AP24928 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms