Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPREP23469 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPREP23469 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPREP23469 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPREP23469 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPREP23469 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPREP23469 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPREP23469 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPREP23469 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPREP23469 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PTPREP23469 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPREP23469 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPREP23469 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPREP23469 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPREP23469 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPREP23469 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPREP23469 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPREP23469 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPREP23469 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPREP23469 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPREP23469 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPREP23469 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPREP23469 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPREP23469 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPREP23469 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPREP23469 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPREP23469 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPREP23469 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPREP23469 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPREP23469 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPREP23469 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPREP23469 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPREP23469 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPREP23469 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPREP23469 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPREP23469 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPREP23469 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPREP23469 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PTPREP23469 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PTPREP23469 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PTPREP23469 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PTPREP23469 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PTPREP23469 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PTPREP23469 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PTPREP23469 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PTPREP23469 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PTPREP23469 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PTPREP23469 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PTPREP23469 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PTPREP23469 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PTPREP23469 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PTPREP23469 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPREP23469 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPREP23469 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPREP23469 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPREP23469 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPREP23469 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPREP23469 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPREP23469 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPREP23469 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPREP23469 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPREP23469 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPREP23469 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPREP23469 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPREP23469 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPREP23469 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPREP23469 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PTPREP23469 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPREP23469 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPREP23469 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPREP23469 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPREP23469 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPREP23469 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPREP23469 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPREP23469 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPREP23469 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPREP23469 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPREP23469 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPREP23469 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPREP23469 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPREP23469 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPREP23469 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PTPREP23469 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPREP23469 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPREP23469 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPREP23469 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPREP23469 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPREP23469 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPREP23469 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPREP23469 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPREP23469 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPREP23469 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPREP23469 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPREP23469 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPREP23469 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPREP23469 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPREP23469 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPREP23469 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPREP23469 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PTPREP23469 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
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