Protein–RNA interactions for Protein: P21860

ERBB3, Receptor tyrosine-protein kinase erbB-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERBB3P21860 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ERBB3P21860 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ERBB3P21860 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ERBB3P21860 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ERBB3P21860 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ERBB3P21860 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ERBB3P21860 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ERBB3P21860 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ERBB3P21860 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ERBB3P21860 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ERBB3P21860 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ERBB3P21860 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ERBB3P21860 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ERBB3P21860 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ERBB3P21860 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ERBB3P21860 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ERBB3P21860 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ERBB3P21860 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ERBB3P21860 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ERBB3P21860 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ERBB3P21860 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ERBB3P21860 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ERBB3P21860 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ERBB3P21860 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ERBB3P21860 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ERBB3P21860 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ERBB3P21860 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ERBB3P21860 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ERBB3P21860 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ERBB3P21860 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ERBB3P21860 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ERBB3P21860 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ERBB3P21860 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ERBB3P21860 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ERBB3P21860 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ERBB3P21860 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ERBB3P21860 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ERBB3P21860 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ERBB3P21860 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ERBB3P21860 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ERBB3P21860 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ERBB3P21860 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ERBB3P21860 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ERBB3P21860 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ERBB3P21860 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ERBB3P21860 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ERBB3P21860 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ERBB3P21860 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ERBB3P21860 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ERBB3P21860 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ERBB3P21860 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ERBB3P21860 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ERBB3P21860 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ERBB3P21860 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ERBB3P21860 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ERBB3P21860 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ERBB3P21860 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ERBB3P21860 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
ERBB3P21860 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ERBB3P21860 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ERBB3P21860 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ERBB3P21860 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ERBB3P21860 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ERBB3P21860 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
ERBB3P21860 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ERBB3P21860 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ERBB3P21860 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ERBB3P21860 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ERBB3P21860 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ERBB3P21860 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ERBB3P21860 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ERBB3P21860 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ERBB3P21860 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ERBB3P21860 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ERBB3P21860 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ERBB3P21860 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ERBB3P21860 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ERBB3P21860 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ERBB3P21860 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ERBB3P21860 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ERBB3P21860 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ERBB3P21860 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ERBB3P21860 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ERBB3P21860 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ERBB3P21860 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ERBB3P21860 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ERBB3P21860 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ERBB3P21860 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ERBB3P21860 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ERBB3P21860 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ERBB3P21860 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ERBB3P21860 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ERBB3P21860 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ERBB3P21860 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ERBB3P21860 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ERBB3P21860 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ERBB3P21860 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ERBB3P21860 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ERBB3P21860 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ERBB3P21860 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms