Protein–RNA interactions for Protein: P20941

PDC, Phosducin, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCP20941 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDCP20941 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDCP20941 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDCP20941 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDCP20941 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDCP20941 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDCP20941 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDCP20941 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDCP20941 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDCP20941 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDCP20941 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDCP20941 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDCP20941 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDCP20941 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDCP20941 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDCP20941 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDCP20941 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDCP20941 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDCP20941 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDCP20941 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDCP20941 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDCP20941 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDCP20941 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDCP20941 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDCP20941 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDCP20941 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDCP20941 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDCP20941 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDCP20941 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDCP20941 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDCP20941 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDCP20941 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDCP20941 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDCP20941 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDCP20941 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDCP20941 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDCP20941 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PDCP20941 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDCP20941 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDCP20941 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDCP20941 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDCP20941 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDCP20941 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDCP20941 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDCP20941 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDCP20941 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDCP20941 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDCP20941 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDCP20941 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDCP20941 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDCP20941 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDCP20941 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDCP20941 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDCP20941 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDCP20941 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDCP20941 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDCP20941 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDCP20941 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDCP20941 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDCP20941 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDCP20941 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDCP20941 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDCP20941 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDCP20941 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDCP20941 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDCP20941 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDCP20941 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PDCP20941 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDCP20941 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDCP20941 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDCP20941 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDCP20941 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDCP20941 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDCP20941 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDCP20941 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDCP20941 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDCP20941 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDCP20941 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDCP20941 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDCP20941 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDCP20941 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDCP20941 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDCP20941 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDCP20941 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDCP20941 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDCP20941 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDCP20941 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDCP20941 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDCP20941 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDCP20941 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDCP20941 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDCP20941 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDCP20941 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDCP20941 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDCP20941 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDCP20941 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDCP20941 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PDCP20941 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PDCP20941 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PDCP20941 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms