Protein–RNA interactions for Protein: P20248

CCNA2, Cyclin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA2P20248 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCNA2P20248 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCNA2P20248 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCNA2P20248 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCNA2P20248 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCNA2P20248 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCNA2P20248 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCNA2P20248 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCNA2P20248 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCNA2P20248 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCNA2P20248 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CCNA2P20248 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCNA2P20248 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCNA2P20248 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCNA2P20248 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CCNA2P20248 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCNA2P20248 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCNA2P20248 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCNA2P20248 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCNA2P20248 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCNA2P20248 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCNA2P20248 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCNA2P20248 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCNA2P20248 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCNA2P20248 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCNA2P20248 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCNA2P20248 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCNA2P20248 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCNA2P20248 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCNA2P20248 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCNA2P20248 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCNA2P20248 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CCNA2P20248 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCNA2P20248 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCNA2P20248 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CCNA2P20248 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCNA2P20248 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCNA2P20248 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCNA2P20248 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCNA2P20248 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCNA2P20248 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCNA2P20248 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCNA2P20248 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCNA2P20248 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCNA2P20248 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCNA2P20248 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCNA2P20248 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCNA2P20248 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCNA2P20248 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCNA2P20248 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCNA2P20248 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCNA2P20248 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCNA2P20248 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCNA2P20248 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCNA2P20248 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCNA2P20248 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCNA2P20248 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCNA2P20248 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCNA2P20248 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCNA2P20248 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCNA2P20248 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCNA2P20248 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CCNA2P20248 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCNA2P20248 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCNA2P20248 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCNA2P20248 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCNA2P20248 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCNA2P20248 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CCNA2P20248 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CCNA2P20248 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCNA2P20248 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCNA2P20248 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCNA2P20248 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCNA2P20248 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCNA2P20248 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCNA2P20248 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCNA2P20248 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CCNA2P20248 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CCNA2P20248 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCNA2P20248 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCNA2P20248 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCNA2P20248 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCNA2P20248 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CCNA2P20248 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CCNA2P20248 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCNA2P20248 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCNA2P20248 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCNA2P20248 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCNA2P20248 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCNA2P20248 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCNA2P20248 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCNA2P20248 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCNA2P20248 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCNA2P20248 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CCNA2P20248 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCNA2P20248 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCNA2P20248 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCNA2P20248 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CCNA2P20248 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CCNA2P20248 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms