Protein–RNA interactions for Protein: P20036

HLA-DPA1, HLA class II histocompatibility antigen, DP alpha 1 chain, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DPA1P20036 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HLA-DPA1P20036 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HLA-DPA1P20036 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
HLA-DPA1P20036 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HLA-DPA1P20036 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HLA-DPA1P20036 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HLA-DPA1P20036 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HLA-DPA1P20036 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HLA-DPA1P20036 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HLA-DPA1P20036 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HLA-DPA1P20036 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HLA-DPA1P20036 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HLA-DPA1P20036 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HLA-DPA1P20036 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HLA-DPA1P20036 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
HLA-DPA1P20036 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HLA-DPA1P20036 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HLA-DPA1P20036 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HLA-DPA1P20036 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
HLA-DPA1P20036 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HLA-DPA1P20036 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HLA-DPA1P20036 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HLA-DPA1P20036 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HLA-DPA1P20036 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HLA-DPA1P20036 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HLA-DPA1P20036 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HLA-DPA1P20036 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HLA-DPA1P20036 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
HLA-DPA1P20036 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
HLA-DPA1P20036 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
HLA-DPA1P20036 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
HLA-DPA1P20036 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
HLA-DPA1P20036 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
HLA-DPA1P20036 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HLA-DPA1P20036 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HLA-DPA1P20036 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HLA-DPA1P20036 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HLA-DPA1P20036 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HLA-DPA1P20036 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HLA-DPA1P20036 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HLA-DPA1P20036 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HLA-DPA1P20036 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HLA-DPA1P20036 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HLA-DPA1P20036 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HLA-DPA1P20036 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HLA-DPA1P20036 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HLA-DPA1P20036 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HLA-DPA1P20036 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
HLA-DPA1P20036 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
HLA-DPA1P20036 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
HLA-DPA1P20036 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HLA-DPA1P20036 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HLA-DPA1P20036 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HLA-DPA1P20036 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HLA-DPA1P20036 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HLA-DPA1P20036 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HLA-DPA1P20036 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HLA-DPA1P20036 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HLA-DPA1P20036 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HLA-DPA1P20036 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HLA-DPA1P20036 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HLA-DPA1P20036 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HLA-DPA1P20036 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HLA-DPA1P20036 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HLA-DPA1P20036 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HLA-DPA1P20036 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HLA-DPA1P20036 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HLA-DPA1P20036 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HLA-DPA1P20036 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HLA-DPA1P20036 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HLA-DPA1P20036 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HLA-DPA1P20036 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HLA-DPA1P20036 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HLA-DPA1P20036 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HLA-DPA1P20036 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HLA-DPA1P20036 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HLA-DPA1P20036 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HLA-DPA1P20036 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HLA-DPA1P20036 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
HLA-DPA1P20036 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HLA-DPA1P20036 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HLA-DPA1P20036 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HLA-DPA1P20036 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
HLA-DPA1P20036 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
HLA-DPA1P20036 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HLA-DPA1P20036 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HLA-DPA1P20036 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HLA-DPA1P20036 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HLA-DPA1P20036 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HLA-DPA1P20036 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HLA-DPA1P20036 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HLA-DPA1P20036 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HLA-DPA1P20036 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HLA-DPA1P20036 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
HLA-DPA1P20036 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HLA-DPA1P20036 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HLA-DPA1P20036 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HLA-DPA1P20036 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HLA-DPA1P20036 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HLA-DPA1P20036 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms