Protein–RNA interactions for Protein: P19429

TNNI3, Troponin I, cardiac muscle, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3P19429 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TNNI3P19429 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TNNI3P19429 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TNNI3P19429 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TNNI3P19429 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
TNNI3P19429 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
TNNI3P19429 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TNNI3P19429 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
TNNI3P19429 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TNNI3P19429 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TNNI3P19429 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TNNI3P19429 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TNNI3P19429 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TNNI3P19429 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TNNI3P19429 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TNNI3P19429 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TNNI3P19429 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
TNNI3P19429 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TNNI3P19429 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TNNI3P19429 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TNNI3P19429 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TNNI3P19429 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TNNI3P19429 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TNNI3P19429 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TNNI3P19429 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TNNI3P19429 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TNNI3P19429 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TNNI3P19429 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TNNI3P19429 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TNNI3P19429 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TNNI3P19429 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TNNI3P19429 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TNNI3P19429 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
TNNI3P19429 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TNNI3P19429 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TNNI3P19429 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TNNI3P19429 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TNNI3P19429 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TNNI3P19429 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TNNI3P19429 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TNNI3P19429 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TNNI3P19429 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TNNI3P19429 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
TNNI3P19429 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TNNI3P19429 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TNNI3P19429 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TNNI3P19429 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TNNI3P19429 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TNNI3P19429 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TNNI3P19429 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TNNI3P19429 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TNNI3P19429 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TNNI3P19429 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TNNI3P19429 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TNNI3P19429 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TNNI3P19429 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TNNI3P19429 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TNNI3P19429 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TNNI3P19429 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TNNI3P19429 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TNNI3P19429 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TNNI3P19429 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TNNI3P19429 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TNNI3P19429 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TNNI3P19429 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TNNI3P19429 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TNNI3P19429 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TNNI3P19429 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
TNNI3P19429 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TNNI3P19429 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
TNNI3P19429 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TNNI3P19429 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
TNNI3P19429 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TNNI3P19429 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TNNI3P19429 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TNNI3P19429 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
TNNI3P19429 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
TNNI3P19429 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TNNI3P19429 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TNNI3P19429 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TNNI3P19429 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TNNI3P19429 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TNNI3P19429 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TNNI3P19429 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TNNI3P19429 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TNNI3P19429 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TNNI3P19429 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TNNI3P19429 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
TNNI3P19429 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TNNI3P19429 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TNNI3P19429 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TNNI3P19429 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TNNI3P19429 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TNNI3P19429 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TNNI3P19429 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TNNI3P19429 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TNNI3P19429 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TNNI3P19429 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TNNI3P19429 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TNNI3P19429 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms