Protein–RNA interactions for Protein: P15941

MUC1, Mucin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MUC1P15941 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MUC1P15941 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MUC1P15941 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MUC1P15941 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MUC1P15941 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MUC1P15941 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
MUC1P15941 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MUC1P15941 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MUC1P15941 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MUC1P15941 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MUC1P15941 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MUC1P15941 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MUC1P15941 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MUC1P15941 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MUC1P15941 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MUC1P15941 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MUC1P15941 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MUC1P15941 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MUC1P15941 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MUC1P15941 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MUC1P15941 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MUC1P15941 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MUC1P15941 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MUC1P15941 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MUC1P15941 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MUC1P15941 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MUC1P15941 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MUC1P15941 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MUC1P15941 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MUC1P15941 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MUC1P15941 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MUC1P15941 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MUC1P15941 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MUC1P15941 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MUC1P15941 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MUC1P15941 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MUC1P15941 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MUC1P15941 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
MUC1P15941 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MUC1P15941 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MUC1P15941 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MUC1P15941 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MUC1P15941 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MUC1P15941 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MUC1P15941 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MUC1P15941 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MUC1P15941 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MUC1P15941 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MUC1P15941 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MUC1P15941 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MUC1P15941 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MUC1P15941 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MUC1P15941 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MUC1P15941 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MUC1P15941 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MUC1P15941 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MUC1P15941 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MUC1P15941 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MUC1P15941 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MUC1P15941 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MUC1P15941 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MUC1P15941 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MUC1P15941 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MUC1P15941 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MUC1P15941 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MUC1P15941 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MUC1P15941 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MUC1P15941 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MUC1P15941 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MUC1P15941 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MUC1P15941 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MUC1P15941 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MUC1P15941 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MUC1P15941 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MUC1P15941 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MUC1P15941 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MUC1P15941 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MUC1P15941 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MUC1P15941 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MUC1P15941 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MUC1P15941 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MUC1P15941 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
MUC1P15941 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MUC1P15941 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
MUC1P15941 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MUC1P15941 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MUC1P15941 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MUC1P15941 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MUC1P15941 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MUC1P15941 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MUC1P15941 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MUC1P15941 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MUC1P15941 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
MUC1P15941 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
MUC1P15941 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
MUC1P15941 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
MUC1P15941 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
MUC1P15941 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
MUC1P15941 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
MUC1P15941 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms