Protein–RNA interactions for Protein: P13500

CCL2, C-C motif chemokine 2, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL2P13500 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCL2P13500 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CCL2P13500 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCL2P13500 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCL2P13500 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CCL2P13500 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CCL2P13500 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCL2P13500 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCL2P13500 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCL2P13500 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCL2P13500 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCL2P13500 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCL2P13500 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCL2P13500 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCL2P13500 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCL2P13500 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCL2P13500 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCL2P13500 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCL2P13500 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCL2P13500 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCL2P13500 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCL2P13500 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCL2P13500 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCL2P13500 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCL2P13500 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCL2P13500 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCL2P13500 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCL2P13500 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CCL2P13500 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCL2P13500 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCL2P13500 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCL2P13500 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCL2P13500 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCL2P13500 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCL2P13500 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCL2P13500 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCL2P13500 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCL2P13500 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCL2P13500 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCL2P13500 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCL2P13500 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCL2P13500 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCL2P13500 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCL2P13500 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCL2P13500 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCL2P13500 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCL2P13500 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCL2P13500 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCL2P13500 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCL2P13500 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCL2P13500 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
CCL2P13500 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCL2P13500 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
CCL2P13500 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCL2P13500 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CCL2P13500 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCL2P13500 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CCL2P13500 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCL2P13500 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCL2P13500 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCL2P13500 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CCL2P13500 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCL2P13500 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CCL2P13500 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCL2P13500 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CCL2P13500 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CCL2P13500 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCL2P13500 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CCL2P13500 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCL2P13500 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCL2P13500 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCL2P13500 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCL2P13500 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCL2P13500 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCL2P13500 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCL2P13500 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCL2P13500 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCL2P13500 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCL2P13500 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCL2P13500 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCL2P13500 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCL2P13500 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCL2P13500 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CCL2P13500 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCL2P13500 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CCL2P13500 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCL2P13500 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCL2P13500 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CCL2P13500 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCL2P13500 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCL2P13500 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCL2P13500 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCL2P13500 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCL2P13500 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCL2P13500 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCL2P13500 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCL2P13500 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCL2P13500 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCL2P13500 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CCL2P13500 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms