Protein–RNA interactions for Protein: P12838

DEFA4, Neutrophil defensin 4, humanhuman

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA4P12838 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
DEFA4P12838 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
DEFA4P12838 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
DEFA4P12838 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
DEFA4P12838 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
DEFA4P12838 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
DEFA4P12838 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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DEFA4P12838 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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DEFA4P12838 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
DEFA4P12838 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
DEFA4P12838 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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DEFA4P12838 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
DEFA4P12838 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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DEFA4P12838 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
DEFA4P12838 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
DEFA4P12838 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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DEFA4P12838 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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DEFA4P12838 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
DEFA4P12838 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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DEFA4P12838 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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DEFA4P12838 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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DEFA4P12838 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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DEFA4P12838 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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DEFA4P12838 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
DEFA4P12838 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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DEFA4P12838 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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DEFA4P12838 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
DEFA4P12838 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
DEFA4P12838 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
DEFA4P12838 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
DEFA4P12838 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
DEFA4P12838 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
DEFA4P12838 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
DEFA4P12838 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
DEFA4P12838 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
DEFA4P12838 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
DEFA4P12838 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
DEFA4P12838 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
DEFA4P12838 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
DEFA4P12838 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
DEFA4P12838 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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