Protein–RNA interactions for Protein: P0DN86

CGB3, Choriogonadotropin subunit beta 3, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGB3P0DN86 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CGB3P0DN86 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CGB3P0DN86 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CGB3P0DN86 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CGB3P0DN86 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CGB3P0DN86 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
CGB3P0DN86 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CGB3P0DN86 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CGB3P0DN86 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CGB3P0DN86 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CGB3P0DN86 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CGB3P0DN86 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CGB3P0DN86 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CGB3P0DN86 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CGB3P0DN86 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CGB3P0DN86 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CGB3P0DN86 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CGB3P0DN86 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CGB3P0DN86 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CGB3P0DN86 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
CGB3P0DN86 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
CGB3P0DN86 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CGB3P0DN86 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CGB3P0DN86 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CGB3P0DN86 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CGB3P0DN86 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CGB3P0DN86 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CGB3P0DN86 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CGB3P0DN86 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CGB3P0DN86 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CGB3P0DN86 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CGB3P0DN86 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CGB3P0DN86 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CGB3P0DN86 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CGB3P0DN86 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CGB3P0DN86 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CGB3P0DN86 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CGB3P0DN86 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CGB3P0DN86 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CGB3P0DN86 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CGB3P0DN86 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CGB3P0DN86 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CGB3P0DN86 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CGB3P0DN86 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CGB3P0DN86 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CGB3P0DN86 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CGB3P0DN86 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CGB3P0DN86 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CGB3P0DN86 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CGB3P0DN86 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CGB3P0DN86 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CGB3P0DN86 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CGB3P0DN86 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CGB3P0DN86 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CGB3P0DN86 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CGB3P0DN86 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CGB3P0DN86 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CGB3P0DN86 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CGB3P0DN86 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CGB3P0DN86 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CGB3P0DN86 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CGB3P0DN86 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CGB3P0DN86 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CGB3P0DN86 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
CGB3P0DN86 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CGB3P0DN86 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
CGB3P0DN86 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CGB3P0DN86 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CGB3P0DN86 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CGB3P0DN86 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CGB3P0DN86 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CGB3P0DN86 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CGB3P0DN86 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CGB3P0DN86 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CGB3P0DN86 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CGB3P0DN86 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CGB3P0DN86 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CGB3P0DN86 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CGB3P0DN86 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CGB3P0DN86 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CGB3P0DN86 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CGB3P0DN86 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CGB3P0DN86 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CGB3P0DN86 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CGB3P0DN86 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CGB3P0DN86 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CGB3P0DN86 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CGB3P0DN86 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CGB3P0DN86 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CGB3P0DN86 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CGB3P0DN86 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CGB3P0DN86 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CGB3P0DN86 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CGB3P0DN86 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CGB3P0DN86 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CGB3P0DN86 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CGB3P0DN86 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CGB3P0DN86 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CGB3P0DN86 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CGB3P0DN86 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms