Protein–RNA interactions for Protein: P0C7P4

UQCRFS1P1, Putative cytochrome b-c1 complex subunit Rieske-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UQCRFS1P1P0C7P4 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
UQCRFS1P1P0C7P4 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
UQCRFS1P1P0C7P4 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
UQCRFS1P1P0C7P4 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
UQCRFS1P1P0C7P4 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
UQCRFS1P1P0C7P4 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
UQCRFS1P1P0C7P4 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
UQCRFS1P1P0C7P4 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
UQCRFS1P1P0C7P4 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
UQCRFS1P1P0C7P4 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
UQCRFS1P1P0C7P4 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
UQCRFS1P1P0C7P4 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
UQCRFS1P1P0C7P4 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
UQCRFS1P1P0C7P4 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
UQCRFS1P1P0C7P4 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
UQCRFS1P1P0C7P4 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UQCRFS1P1P0C7P4 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
UQCRFS1P1P0C7P4 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
UQCRFS1P1P0C7P4 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
UQCRFS1P1P0C7P4 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UQCRFS1P1P0C7P4 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UQCRFS1P1P0C7P4 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UQCRFS1P1P0C7P4 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
UQCRFS1P1P0C7P4 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
UQCRFS1P1P0C7P4 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UQCRFS1P1P0C7P4 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UQCRFS1P1P0C7P4 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UQCRFS1P1P0C7P4 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
UQCRFS1P1P0C7P4 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UQCRFS1P1P0C7P4 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
UQCRFS1P1P0C7P4 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
UQCRFS1P1P0C7P4 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
UQCRFS1P1P0C7P4 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UQCRFS1P1P0C7P4 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UQCRFS1P1P0C7P4 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
UQCRFS1P1P0C7P4 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
UQCRFS1P1P0C7P4 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
UQCRFS1P1P0C7P4 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UQCRFS1P1P0C7P4 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UQCRFS1P1P0C7P4 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UQCRFS1P1P0C7P4 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
UQCRFS1P1P0C7P4 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
UQCRFS1P1P0C7P4 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
UQCRFS1P1P0C7P4 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UQCRFS1P1P0C7P4 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UQCRFS1P1P0C7P4 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UQCRFS1P1P0C7P4 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UQCRFS1P1P0C7P4 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UQCRFS1P1P0C7P4 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UQCRFS1P1P0C7P4 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UQCRFS1P1P0C7P4 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UQCRFS1P1P0C7P4 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UQCRFS1P1P0C7P4 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UQCRFS1P1P0C7P4 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
UQCRFS1P1P0C7P4 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UQCRFS1P1P0C7P4 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
UQCRFS1P1P0C7P4 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UQCRFS1P1P0C7P4 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UQCRFS1P1P0C7P4 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UQCRFS1P1P0C7P4 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UQCRFS1P1P0C7P4 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
UQCRFS1P1P0C7P4 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UQCRFS1P1P0C7P4 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UQCRFS1P1P0C7P4 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UQCRFS1P1P0C7P4 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UQCRFS1P1P0C7P4 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
UQCRFS1P1P0C7P4 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UQCRFS1P1P0C7P4 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UQCRFS1P1P0C7P4 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UQCRFS1P1P0C7P4 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UQCRFS1P1P0C7P4 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UQCRFS1P1P0C7P4 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UQCRFS1P1P0C7P4 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UQCRFS1P1P0C7P4 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UQCRFS1P1P0C7P4 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
UQCRFS1P1P0C7P4 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
UQCRFS1P1P0C7P4 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UQCRFS1P1P0C7P4 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UQCRFS1P1P0C7P4 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UQCRFS1P1P0C7P4 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UQCRFS1P1P0C7P4 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UQCRFS1P1P0C7P4 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UQCRFS1P1P0C7P4 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UQCRFS1P1P0C7P4 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UQCRFS1P1P0C7P4 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UQCRFS1P1P0C7P4 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UQCRFS1P1P0C7P4 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UQCRFS1P1P0C7P4 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UQCRFS1P1P0C7P4 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UQCRFS1P1P0C7P4 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UQCRFS1P1P0C7P4 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UQCRFS1P1P0C7P4 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UQCRFS1P1P0C7P4 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UQCRFS1P1P0C7P4 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UQCRFS1P1P0C7P4 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UQCRFS1P1P0C7P4 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UQCRFS1P1P0C7P4 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UQCRFS1P1P0C7P4 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
UQCRFS1P1P0C7P4 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UQCRFS1P1P0C7P4 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms