Protein–RNA interactions for Protein: P09110

ACAA1, 3-ketoacyl-CoA thiolase, peroxisomal, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACAA1P09110 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACAA1P09110 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACAA1P09110 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACAA1P09110 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACAA1P09110 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACAA1P09110 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACAA1P09110 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACAA1P09110 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACAA1P09110 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACAA1P09110 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACAA1P09110 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ACAA1P09110 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACAA1P09110 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ACAA1P09110 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ACAA1P09110 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACAA1P09110 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACAA1P09110 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACAA1P09110 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACAA1P09110 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACAA1P09110 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACAA1P09110 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACAA1P09110 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACAA1P09110 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACAA1P09110 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACAA1P09110 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACAA1P09110 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACAA1P09110 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACAA1P09110 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACAA1P09110 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACAA1P09110 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ACAA1P09110 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACAA1P09110 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACAA1P09110 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACAA1P09110 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ACAA1P09110 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACAA1P09110 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACAA1P09110 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACAA1P09110 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACAA1P09110 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACAA1P09110 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACAA1P09110 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACAA1P09110 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACAA1P09110 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ACAA1P09110 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ACAA1P09110 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACAA1P09110 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ACAA1P09110 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ACAA1P09110 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACAA1P09110 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACAA1P09110 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ACAA1P09110 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ACAA1P09110 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACAA1P09110 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ACAA1P09110 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACAA1P09110 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACAA1P09110 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACAA1P09110 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACAA1P09110 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACAA1P09110 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACAA1P09110 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACAA1P09110 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACAA1P09110 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACAA1P09110 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACAA1P09110 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACAA1P09110 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACAA1P09110 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACAA1P09110 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACAA1P09110 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ACAA1P09110 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ACAA1P09110 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACAA1P09110 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACAA1P09110 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACAA1P09110 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACAA1P09110 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACAA1P09110 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACAA1P09110 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACAA1P09110 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACAA1P09110 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ACAA1P09110 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACAA1P09110 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACAA1P09110 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACAA1P09110 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ACAA1P09110 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACAA1P09110 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACAA1P09110 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACAA1P09110 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACAA1P09110 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACAA1P09110 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACAA1P09110 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACAA1P09110 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACAA1P09110 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACAA1P09110 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACAA1P09110 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACAA1P09110 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACAA1P09110 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACAA1P09110 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACAA1P09110 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ACAA1P09110 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
ACAA1P09110 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ACAA1P09110 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms