Protein–RNA interactions for Protein: P08238

HSP90AB1, Heat shock protein HSP 90-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSP90AB1P08238 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HSP90AB1P08238 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HSP90AB1P08238 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HSP90AB1P08238 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HSP90AB1P08238 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HSP90AB1P08238 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HSP90AB1P08238 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HSP90AB1P08238 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HSP90AB1P08238 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HSP90AB1P08238 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HSP90AB1P08238 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HSP90AB1P08238 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HSP90AB1P08238 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HSP90AB1P08238 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HSP90AB1P08238 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HSP90AB1P08238 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
HSP90AB1P08238 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HSP90AB1P08238 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
HSP90AB1P08238 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HSP90AB1P08238 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HSP90AB1P08238 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
HSP90AB1P08238 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
HSP90AB1P08238 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HSP90AB1P08238 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HSP90AB1P08238 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HSP90AB1P08238 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HSP90AB1P08238 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HSP90AB1P08238 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HSP90AB1P08238 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HSP90AB1P08238 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
HSP90AB1P08238 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HSP90AB1P08238 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HSP90AB1P08238 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HSP90AB1P08238 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HSP90AB1P08238 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HSP90AB1P08238 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HSP90AB1P08238 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
HSP90AB1P08238 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HSP90AB1P08238 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HSP90AB1P08238 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HSP90AB1P08238 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
HSP90AB1P08238 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HSP90AB1P08238 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HSP90AB1P08238 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HSP90AB1P08238 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HSP90AB1P08238 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HSP90AB1P08238 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HSP90AB1P08238 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HSP90AB1P08238 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HSP90AB1P08238 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HSP90AB1P08238 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HSP90AB1P08238 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HSP90AB1P08238 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HSP90AB1P08238 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HSP90AB1P08238 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HSP90AB1P08238 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HSP90AB1P08238 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HSP90AB1P08238 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HSP90AB1P08238 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HSP90AB1P08238 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HSP90AB1P08238 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HSP90AB1P08238 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HSP90AB1P08238 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HSP90AB1P08238 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
HSP90AB1P08238 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HSP90AB1P08238 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HSP90AB1P08238 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HSP90AB1P08238 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HSP90AB1P08238 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
HSP90AB1P08238 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HSP90AB1P08238 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HSP90AB1P08238 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HSP90AB1P08238 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HSP90AB1P08238 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HSP90AB1P08238 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HSP90AB1P08238 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HSP90AB1P08238 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HSP90AB1P08238 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HSP90AB1P08238 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HSP90AB1P08238 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HSP90AB1P08238 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HSP90AB1P08238 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HSP90AB1P08238 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HSP90AB1P08238 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HSP90AB1P08238 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HSP90AB1P08238 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HSP90AB1P08238 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HSP90AB1P08238 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HSP90AB1P08238 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HSP90AB1P08238 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HSP90AB1P08238 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HSP90AB1P08238 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HSP90AB1P08238 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HSP90AB1P08238 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HSP90AB1P08238 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
HSP90AB1P08238 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HSP90AB1P08238 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HSP90AB1P08238 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HSP90AB1P08238 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HSP90AB1P08238 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms