Protein–RNA interactions for Protein: P07711

CTSL, Cathepsin L1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSLP07711 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTSLP07711 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTSLP07711 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTSLP07711 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CTSLP07711 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CTSLP07711 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CTSLP07711 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CTSLP07711 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTSLP07711 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTSLP07711 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTSLP07711 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTSLP07711 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTSLP07711 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTSLP07711 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTSLP07711 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTSLP07711 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CTSLP07711 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTSLP07711 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTSLP07711 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTSLP07711 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTSLP07711 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTSLP07711 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CTSLP07711 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CTSLP07711 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTSLP07711 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTSLP07711 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTSLP07711 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTSLP07711 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTSLP07711 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTSLP07711 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTSLP07711 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTSLP07711 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTSLP07711 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTSLP07711 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CTSLP07711 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTSLP07711 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTSLP07711 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTSLP07711 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTSLP07711 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTSLP07711 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTSLP07711 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTSLP07711 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTSLP07711 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTSLP07711 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTSLP07711 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTSLP07711 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTSLP07711 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTSLP07711 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTSLP07711 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTSLP07711 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTSLP07711 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CTSLP07711 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTSLP07711 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTSLP07711 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTSLP07711 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTSLP07711 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTSLP07711 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTSLP07711 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTSLP07711 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTSLP07711 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTSLP07711 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CTSLP07711 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTSLP07711 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CTSLP07711 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTSLP07711 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTSLP07711 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CTSLP07711 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTSLP07711 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CTSLP07711 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTSLP07711 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTSLP07711 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CTSLP07711 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTSLP07711 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTSLP07711 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTSLP07711 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTSLP07711 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTSLP07711 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTSLP07711 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTSLP07711 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTSLP07711 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTSLP07711 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTSLP07711 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTSLP07711 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CTSLP07711 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTSLP07711 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CTSLP07711 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CTSLP07711 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTSLP07711 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTSLP07711 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTSLP07711 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTSLP07711 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTSLP07711 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTSLP07711 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTSLP07711 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CTSLP07711 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CTSLP07711 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTSLP07711 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTSLP07711 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTSLP07711 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CTSLP07711 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms