Protein–RNA interactions for Protein: P05546

SERPIND1, Heparin cofactor 2, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPIND1P05546 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SERPIND1P05546 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SERPIND1P05546 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SERPIND1P05546 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SERPIND1P05546 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SERPIND1P05546 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SERPIND1P05546 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SERPIND1P05546 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SERPIND1P05546 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SERPIND1P05546 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SERPIND1P05546 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SERPIND1P05546 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SERPIND1P05546 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SERPIND1P05546 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SERPIND1P05546 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SERPIND1P05546 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SERPIND1P05546 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SERPIND1P05546 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SERPIND1P05546 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SERPIND1P05546 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SERPIND1P05546 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SERPIND1P05546 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SERPIND1P05546 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SERPIND1P05546 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SERPIND1P05546 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SERPIND1P05546 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SERPIND1P05546 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SERPIND1P05546 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SERPIND1P05546 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SERPIND1P05546 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SERPIND1P05546 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SERPIND1P05546 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SERPIND1P05546 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SERPIND1P05546 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SERPIND1P05546 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SERPIND1P05546 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SERPIND1P05546 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SERPIND1P05546 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SERPIND1P05546 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SERPIND1P05546 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SERPIND1P05546 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SERPIND1P05546 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SERPIND1P05546 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SERPIND1P05546 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SERPIND1P05546 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SERPIND1P05546 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SERPIND1P05546 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SERPIND1P05546 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SERPIND1P05546 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SERPIND1P05546 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SERPIND1P05546 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SERPIND1P05546 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SERPIND1P05546 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SERPIND1P05546 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SERPIND1P05546 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SERPIND1P05546 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SERPIND1P05546 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SERPIND1P05546 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SERPIND1P05546 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SERPIND1P05546 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SERPIND1P05546 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SERPIND1P05546 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SERPIND1P05546 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SERPIND1P05546 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SERPIND1P05546 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SERPIND1P05546 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SERPIND1P05546 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SERPIND1P05546 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SERPIND1P05546 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SERPIND1P05546 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SERPIND1P05546 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SERPIND1P05546 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SERPIND1P05546 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SERPIND1P05546 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SERPIND1P05546 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SERPIND1P05546 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SERPIND1P05546 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SERPIND1P05546 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SERPIND1P05546 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SERPIND1P05546 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SERPIND1P05546 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SERPIND1P05546 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SERPIND1P05546 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SERPIND1P05546 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SERPIND1P05546 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SERPIND1P05546 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SERPIND1P05546 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SERPIND1P05546 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SERPIND1P05546 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SERPIND1P05546 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SERPIND1P05546 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SERPIND1P05546 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SERPIND1P05546 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SERPIND1P05546 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SERPIND1P05546 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SERPIND1P05546 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
SERPIND1P05546 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SERPIND1P05546 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SERPIND1P05546 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SERPIND1P05546 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms