Protein–RNA interactions for Protein: P05107

ITGB2, Integrin beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB2P05107 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGB2P05107 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGB2P05107 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGB2P05107 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGB2P05107 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGB2P05107 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGB2P05107 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGB2P05107 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGB2P05107 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGB2P05107 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGB2P05107 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGB2P05107 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGB2P05107 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGB2P05107 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ITGB2P05107 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
ITGB2P05107 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
ITGB2P05107 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
ITGB2P05107 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.34
ITGB2P05107 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGB2P05107 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGB2P05107 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGB2P05107 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGB2P05107 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGB2P05107 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGB2P05107 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGB2P05107 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGB2P05107 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGB2P05107 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGB2P05107 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGB2P05107 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGB2P05107 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGB2P05107 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGB2P05107 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGB2P05107 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGB2P05107 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGB2P05107 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGB2P05107 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGB2P05107 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGB2P05107 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGB2P05107 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGB2P05107 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGB2P05107 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGB2P05107 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGB2P05107 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGB2P05107 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGB2P05107 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGB2P05107 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGB2P05107 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGB2P05107 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGB2P05107 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGB2P05107 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGB2P05107 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGB2P05107 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGB2P05107 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ITGB2P05107 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGB2P05107 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGB2P05107 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGB2P05107 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGB2P05107 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGB2P05107 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGB2P05107 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGB2P05107 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGB2P05107 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGB2P05107 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGB2P05107 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGB2P05107 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGB2P05107 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGB2P05107 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGB2P05107 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGB2P05107 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGB2P05107 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGB2P05107 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGB2P05107 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGB2P05107 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGB2P05107 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGB2P05107 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGB2P05107 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGB2P05107 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGB2P05107 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGB2P05107 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGB2P05107 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGB2P05107 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGB2P05107 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGB2P05107 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGB2P05107 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGB2P05107 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGB2P05107 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGB2P05107 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGB2P05107 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ITGB2P05107 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGB2P05107 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGB2P05107 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGB2P05107 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGB2P05107 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGB2P05107 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGB2P05107 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGB2P05107 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGB2P05107 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGB2P05107 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ITGB2P05107 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms