Protein–RNA interactions for Protein: P04216

THY1, Thy-1 membrane glycoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THY1P04216 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
THY1P04216 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
THY1P04216 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
THY1P04216 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
THY1P04216 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
THY1P04216 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
THY1P04216 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
THY1P04216 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
THY1P04216 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
THY1P04216 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
THY1P04216 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
THY1P04216 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
THY1P04216 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
THY1P04216 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
THY1P04216 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
THY1P04216 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
THY1P04216 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
THY1P04216 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
THY1P04216 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
THY1P04216 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
THY1P04216 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
THY1P04216 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
THY1P04216 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
THY1P04216 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
THY1P04216 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
THY1P04216 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
THY1P04216 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
THY1P04216 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
THY1P04216 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
THY1P04216 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
THY1P04216 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
THY1P04216 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
THY1P04216 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
THY1P04216 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
THY1P04216 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
THY1P04216 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
THY1P04216 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
THY1P04216 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
THY1P04216 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
THY1P04216 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
THY1P04216 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
THY1P04216 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
THY1P04216 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
THY1P04216 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
THY1P04216 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
THY1P04216 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
THY1P04216 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
THY1P04216 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
THY1P04216 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
THY1P04216 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
THY1P04216 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
THY1P04216 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
THY1P04216 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
THY1P04216 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
THY1P04216 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
THY1P04216 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
THY1P04216 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
THY1P04216 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
THY1P04216 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
THY1P04216 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
THY1P04216 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
THY1P04216 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
THY1P04216 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
THY1P04216 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
THY1P04216 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
THY1P04216 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
THY1P04216 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
THY1P04216 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
THY1P04216 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
THY1P04216 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
THY1P04216 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
THY1P04216 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
THY1P04216 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
THY1P04216 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
THY1P04216 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
THY1P04216 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
THY1P04216 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
THY1P04216 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
THY1P04216 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
THY1P04216 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
THY1P04216 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
THY1P04216 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
THY1P04216 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
THY1P04216 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
THY1P04216 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
THY1P04216 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
THY1P04216 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
THY1P04216 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
THY1P04216 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
THY1P04216 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
THY1P04216 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
THY1P04216 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
THY1P04216 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
THY1P04216 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
THY1P04216 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
THY1P04216 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
THY1P04216 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
THY1P04216 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
THY1P04216 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
THY1P04216 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms