Protein–RNA interactions for Protein: O95475

SIX6, Homeobox protein SIX6, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX6O95475 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SIX6O95475 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SIX6O95475 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SIX6O95475 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SIX6O95475 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SIX6O95475 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SIX6O95475 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIX6O95475 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIX6O95475 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIX6O95475 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIX6O95475 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIX6O95475 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIX6O95475 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SIX6O95475 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIX6O95475 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SIX6O95475 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIX6O95475 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIX6O95475 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIX6O95475 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIX6O95475 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIX6O95475 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SIX6O95475 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SIX6O95475 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIX6O95475 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIX6O95475 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIX6O95475 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIX6O95475 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIX6O95475 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIX6O95475 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIX6O95475 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIX6O95475 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIX6O95475 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIX6O95475 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIX6O95475 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIX6O95475 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIX6O95475 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SIX6O95475 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIX6O95475 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIX6O95475 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIX6O95475 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIX6O95475 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIX6O95475 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIX6O95475 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIX6O95475 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SIX6O95475 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIX6O95475 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SIX6O95475 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIX6O95475 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIX6O95475 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIX6O95475 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIX6O95475 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIX6O95475 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIX6O95475 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIX6O95475 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIX6O95475 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIX6O95475 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIX6O95475 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIX6O95475 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIX6O95475 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIX6O95475 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SIX6O95475 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIX6O95475 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIX6O95475 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIX6O95475 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIX6O95475 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIX6O95475 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIX6O95475 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIX6O95475 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIX6O95475 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SIX6O95475 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIX6O95475 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIX6O95475 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIX6O95475 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIX6O95475 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIX6O95475 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIX6O95475 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIX6O95475 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIX6O95475 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIX6O95475 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIX6O95475 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIX6O95475 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIX6O95475 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIX6O95475 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIX6O95475 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SIX6O95475 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIX6O95475 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIX6O95475 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIX6O95475 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIX6O95475 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIX6O95475 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIX6O95475 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIX6O95475 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIX6O95475 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIX6O95475 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIX6O95475 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SIX6O95475 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SIX6O95475 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SIX6O95475 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SIX6O95475 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SIX6O95475 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms