Protein–RNA interactions for Protein: O75177

SS18L1, Calcium-responsive transactivator, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18L1O75177 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SS18L1O75177 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SS18L1O75177 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SS18L1O75177 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SS18L1O75177 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SS18L1O75177 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SS18L1O75177 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SS18L1O75177 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SS18L1O75177 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SS18L1O75177 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SS18L1O75177 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SS18L1O75177 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SS18L1O75177 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SS18L1O75177 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SS18L1O75177 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SS18L1O75177 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SS18L1O75177 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SS18L1O75177 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SS18L1O75177 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SS18L1O75177 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SS18L1O75177 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SS18L1O75177 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SS18L1O75177 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SS18L1O75177 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SS18L1O75177 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SS18L1O75177 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SS18L1O75177 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SS18L1O75177 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SS18L1O75177 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SS18L1O75177 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SS18L1O75177 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SS18L1O75177 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SS18L1O75177 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SS18L1O75177 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SS18L1O75177 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SS18L1O75177 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SS18L1O75177 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SS18L1O75177 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SS18L1O75177 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SS18L1O75177 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SS18L1O75177 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SS18L1O75177 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SS18L1O75177 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SS18L1O75177 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SS18L1O75177 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SS18L1O75177 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SS18L1O75177 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SS18L1O75177 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SS18L1O75177 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SS18L1O75177 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SS18L1O75177 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SS18L1O75177 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SS18L1O75177 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SS18L1O75177 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SS18L1O75177 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SS18L1O75177 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SS18L1O75177 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SS18L1O75177 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SS18L1O75177 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SS18L1O75177 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SS18L1O75177 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SS18L1O75177 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SS18L1O75177 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SS18L1O75177 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SS18L1O75177 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SS18L1O75177 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SS18L1O75177 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SS18L1O75177 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SS18L1O75177 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SS18L1O75177 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SS18L1O75177 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SS18L1O75177 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SS18L1O75177 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SS18L1O75177 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SS18L1O75177 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SS18L1O75177 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SS18L1O75177 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SS18L1O75177 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SS18L1O75177 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SS18L1O75177 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SS18L1O75177 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SS18L1O75177 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SS18L1O75177 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SS18L1O75177 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SS18L1O75177 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SS18L1O75177 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SS18L1O75177 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SS18L1O75177 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SS18L1O75177 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SS18L1O75177 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SS18L1O75177 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SS18L1O75177 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SS18L1O75177 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SS18L1O75177 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SS18L1O75177 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SS18L1O75177 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SS18L1O75177 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SS18L1O75177 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SS18L1O75177 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SS18L1O75177 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms