Protein–RNA interactions for Protein: O75161

NPHP4, Nephrocystin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHP4O75161 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NPHP4O75161 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NPHP4O75161 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NPHP4O75161 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NPHP4O75161 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NPHP4O75161 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NPHP4O75161 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NPHP4O75161 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NPHP4O75161 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NPHP4O75161 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NPHP4O75161 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NPHP4O75161 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NPHP4O75161 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NPHP4O75161 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NPHP4O75161 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NPHP4O75161 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NPHP4O75161 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NPHP4O75161 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NPHP4O75161 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NPHP4O75161 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NPHP4O75161 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NPHP4O75161 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NPHP4O75161 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NPHP4O75161 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NPHP4O75161 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NPHP4O75161 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NPHP4O75161 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NPHP4O75161 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NPHP4O75161 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NPHP4O75161 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NPHP4O75161 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NPHP4O75161 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
NPHP4O75161 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
NPHP4O75161 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
NPHP4O75161 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
NPHP4O75161 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NPHP4O75161 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NPHP4O75161 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NPHP4O75161 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NPHP4O75161 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NPHP4O75161 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
NPHP4O75161 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NPHP4O75161 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NPHP4O75161 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NPHP4O75161 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
NPHP4O75161 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NPHP4O75161 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NPHP4O75161 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NPHP4O75161 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NPHP4O75161 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NPHP4O75161 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NPHP4O75161 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NPHP4O75161 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NPHP4O75161 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
NPHP4O75161 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
NPHP4O75161 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NPHP4O75161 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NPHP4O75161 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NPHP4O75161 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NPHP4O75161 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
NPHP4O75161 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NPHP4O75161 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NPHP4O75161 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NPHP4O75161 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NPHP4O75161 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NPHP4O75161 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NPHP4O75161 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NPHP4O75161 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NPHP4O75161 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NPHP4O75161 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NPHP4O75161 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NPHP4O75161 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NPHP4O75161 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NPHP4O75161 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NPHP4O75161 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NPHP4O75161 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
NPHP4O75161 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NPHP4O75161 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NPHP4O75161 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NPHP4O75161 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NPHP4O75161 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NPHP4O75161 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NPHP4O75161 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NPHP4O75161 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NPHP4O75161 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
NPHP4O75161 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
NPHP4O75161 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NPHP4O75161 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NPHP4O75161 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NPHP4O75161 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NPHP4O75161 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NPHP4O75161 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NPHP4O75161 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NPHP4O75161 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NPHP4O75161 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NPHP4O75161 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NPHP4O75161 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NPHP4O75161 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NPHP4O75161 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NPHP4O75161 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms