Protein–RNA interactions for Protein: O60885

BRD4, Bromodomain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD4O60885 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BRD4O60885 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BRD4O60885 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
BRD4O60885 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
BRD4O60885 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
BRD4O60885 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
BRD4O60885 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
BRD4O60885 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
BRD4O60885 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
BRD4O60885 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
BRD4O60885 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
BRD4O60885 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
BRD4O60885 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BRD4O60885 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BRD4O60885 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BRD4O60885 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BRD4O60885 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BRD4O60885 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BRD4O60885 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
BRD4O60885 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BRD4O60885 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BRD4O60885 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BRD4O60885 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BRD4O60885 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BRD4O60885 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
BRD4O60885 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BRD4O60885 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BRD4O60885 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BRD4O60885 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
BRD4O60885 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BRD4O60885 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BRD4O60885 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BRD4O60885 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BRD4O60885 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BRD4O60885 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
BRD4O60885 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BRD4O60885 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
BRD4O60885 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
BRD4O60885 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
BRD4O60885 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BRD4O60885 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BRD4O60885 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BRD4O60885 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BRD4O60885 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BRD4O60885 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BRD4O60885 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
BRD4O60885 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
BRD4O60885 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
BRD4O60885 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
BRD4O60885 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
BRD4O60885 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
BRD4O60885 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
BRD4O60885 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
BRD4O60885 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
BRD4O60885 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
BRD4O60885 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
BRD4O60885 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
BRD4O60885 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
BRD4O60885 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
BRD4O60885 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
BRD4O60885 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
BRD4O60885 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
BRD4O60885 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
BRD4O60885 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
BRD4O60885 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
BRD4O60885 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
BRD4O60885 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
BRD4O60885 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
BRD4O60885 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
BRD4O60885 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
BRD4O60885 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
BRD4O60885 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
BRD4O60885 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
BRD4O60885 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
BRD4O60885 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
BRD4O60885 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
BRD4O60885 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
BRD4O60885 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
BRD4O60885 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
BRD4O60885 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
BRD4O60885 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
BRD4O60885 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
BRD4O60885 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
BRD4O60885 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
BRD4O60885 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
BRD4O60885 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
BRD4O60885 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
BRD4O60885 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BRD4O60885 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
BRD4O60885 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BRD4O60885 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BRD4O60885 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BRD4O60885 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BRD4O60885 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
BRD4O60885 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BRD4O60885 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BRD4O60885 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
BRD4O60885 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
BRD4O60885 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BRD4O60885 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms