Protein–RNA interactions for Protein: O43525

KCNQ3, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 3, humanhuman

Predictions only

Length 872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ3O43525 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
KCNQ3O43525 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KCNQ3O43525 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KCNQ3O43525 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KCNQ3O43525 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KCNQ3O43525 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KCNQ3O43525 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KCNQ3O43525 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
KCNQ3O43525 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KCNQ3O43525 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
KCNQ3O43525 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KCNQ3O43525 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KCNQ3O43525 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KCNQ3O43525 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KCNQ3O43525 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KCNQ3O43525 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KCNQ3O43525 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KCNQ3O43525 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KCNQ3O43525 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
KCNQ3O43525 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
KCNQ3O43525 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KCNQ3O43525 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KCNQ3O43525 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KCNQ3O43525 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
KCNQ3O43525 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KCNQ3O43525 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KCNQ3O43525 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KCNQ3O43525 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KCNQ3O43525 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
KCNQ3O43525 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KCNQ3O43525 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KCNQ3O43525 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KCNQ3O43525 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KCNQ3O43525 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KCNQ3O43525 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KCNQ3O43525 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KCNQ3O43525 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KCNQ3O43525 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KCNQ3O43525 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KCNQ3O43525 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KCNQ3O43525 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
KCNQ3O43525 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
KCNQ3O43525 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KCNQ3O43525 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KCNQ3O43525 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KCNQ3O43525 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KCNQ3O43525 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KCNQ3O43525 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KCNQ3O43525 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KCNQ3O43525 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KCNQ3O43525 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
KCNQ3O43525 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
KCNQ3O43525 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KCNQ3O43525 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KCNQ3O43525 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KCNQ3O43525 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KCNQ3O43525 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KCNQ3O43525 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KCNQ3O43525 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KCNQ3O43525 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KCNQ3O43525 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KCNQ3O43525 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KCNQ3O43525 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KCNQ3O43525 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KCNQ3O43525 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KCNQ3O43525 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KCNQ3O43525 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KCNQ3O43525 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KCNQ3O43525 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KCNQ3O43525 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
KCNQ3O43525 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
KCNQ3O43525 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KCNQ3O43525 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KCNQ3O43525 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KCNQ3O43525 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KCNQ3O43525 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KCNQ3O43525 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KCNQ3O43525 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KCNQ3O43525 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KCNQ3O43525 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KCNQ3O43525 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
KCNQ3O43525 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KCNQ3O43525 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KCNQ3O43525 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCNQ3O43525 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCNQ3O43525 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCNQ3O43525 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCNQ3O43525 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCNQ3O43525 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCNQ3O43525 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCNQ3O43525 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCNQ3O43525 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCNQ3O43525 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCNQ3O43525 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCNQ3O43525 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCNQ3O43525 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCNQ3O43525 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCNQ3O43525 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCNQ3O43525 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KCNQ3O43525 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms