Protein–RNA interactions for Protein: O15516

CLOCK, Circadian locomoter output cycles protein kaput, humanhuman

Predictions only

Length 846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLOCKO15516 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CLOCKO15516 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CLOCKO15516 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CLOCKO15516 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CLOCKO15516 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CLOCKO15516 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CLOCKO15516 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CLOCKO15516 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CLOCKO15516 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CLOCKO15516 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CLOCKO15516 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CLOCKO15516 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CLOCKO15516 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CLOCKO15516 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CLOCKO15516 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CLOCKO15516 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CLOCKO15516 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CLOCKO15516 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CLOCKO15516 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CLOCKO15516 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CLOCKO15516 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CLOCKO15516 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
CLOCKO15516 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CLOCKO15516 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CLOCKO15516 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CLOCKO15516 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CLOCKO15516 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CLOCKO15516 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CLOCKO15516 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CLOCKO15516 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CLOCKO15516 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CLOCKO15516 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CLOCKO15516 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CLOCKO15516 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CLOCKO15516 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CLOCKO15516 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CLOCKO15516 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CLOCKO15516 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CLOCKO15516 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CLOCKO15516 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CLOCKO15516 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CLOCKO15516 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CLOCKO15516 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CLOCKO15516 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CLOCKO15516 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLOCKO15516 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLOCKO15516 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLOCKO15516 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLOCKO15516 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLOCKO15516 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLOCKO15516 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLOCKO15516 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLOCKO15516 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLOCKO15516 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLOCKO15516 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLOCKO15516 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLOCKO15516 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLOCKO15516 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLOCKO15516 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLOCKO15516 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLOCKO15516 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLOCKO15516 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLOCKO15516 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLOCKO15516 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLOCKO15516 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLOCKO15516 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLOCKO15516 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLOCKO15516 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLOCKO15516 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLOCKO15516 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLOCKO15516 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLOCKO15516 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLOCKO15516 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLOCKO15516 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLOCKO15516 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLOCKO15516 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLOCKO15516 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
CLOCKO15516 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CLOCKO15516 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CLOCKO15516 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CLOCKO15516 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CLOCKO15516 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CLOCKO15516 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CLOCKO15516 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CLOCKO15516 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CLOCKO15516 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CLOCKO15516 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CLOCKO15516 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CLOCKO15516 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CLOCKO15516 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CLOCKO15516 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CLOCKO15516 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CLOCKO15516 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CLOCKO15516 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CLOCKO15516 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
CLOCKO15516 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CLOCKO15516 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
CLOCKO15516 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CLOCKO15516 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
CLOCKO15516 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms