Protein–RNA interactions for Protein: O15178

T, Brachyury protein, humanhuman

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Length 435 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TO15178 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
TO15178 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
TO15178 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TO15178 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TO15178 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TO15178 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TO15178 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TO15178 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TO15178 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TO15178 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TO15178 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TO15178 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TO15178 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TO15178 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TO15178 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TO15178 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TO15178 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TO15178 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TO15178 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TO15178 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TO15178 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TO15178 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TO15178 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TO15178 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TO15178 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TO15178 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TO15178 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TO15178 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TO15178 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TO15178 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TO15178 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TO15178 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TO15178 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TO15178 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TO15178 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TO15178 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TO15178 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TO15178 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TO15178 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TO15178 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TO15178 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TO15178 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TO15178 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TO15178 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TO15178 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TO15178 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TO15178 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TO15178 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TO15178 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TO15178 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TO15178 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
TO15178 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TO15178 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TO15178 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TO15178 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TO15178 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TO15178 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TO15178 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TO15178 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TO15178 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TO15178 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TO15178 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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TO15178 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TO15178 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TO15178 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
TO15178 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
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TO15178 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TO15178 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TO15178 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TO15178 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
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TO15178 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TO15178 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TO15178 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TO15178 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TO15178 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
TO15178 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TO15178 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TO15178 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
TO15178 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TO15178 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TO15178 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TO15178 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TO15178 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TO15178 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TO15178 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TO15178 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TO15178 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TO15178 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TO15178 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TO15178 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
TO15178 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TO15178 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TO15178 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TO15178 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TO15178 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TO15178 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
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