Protein–RNA interactions for Protein: O15084

ANKRD28, Serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory ankyrin repeat subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28O15084 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ANKRD28O15084 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ANKRD28O15084 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ANKRD28O15084 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ANKRD28O15084 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ANKRD28O15084 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ANKRD28O15084 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ANKRD28O15084 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ANKRD28O15084 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ANKRD28O15084 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ANKRD28O15084 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ANKRD28O15084 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ANKRD28O15084 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ANKRD28O15084 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ANKRD28O15084 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ANKRD28O15084 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ANKRD28O15084 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ANKRD28O15084 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ANKRD28O15084 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ANKRD28O15084 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ANKRD28O15084 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ANKRD28O15084 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ANKRD28O15084 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ANKRD28O15084 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ANKRD28O15084 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ANKRD28O15084 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ANKRD28O15084 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ANKRD28O15084 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ANKRD28O15084 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ANKRD28O15084 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ANKRD28O15084 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ANKRD28O15084 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ANKRD28O15084 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ANKRD28O15084 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ANKRD28O15084 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ANKRD28O15084 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ANKRD28O15084 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ANKRD28O15084 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ANKRD28O15084 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ANKRD28O15084 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ANKRD28O15084 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ANKRD28O15084 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ANKRD28O15084 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ANKRD28O15084 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ANKRD28O15084 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ANKRD28O15084 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ANKRD28O15084 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ANKRD28O15084 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ANKRD28O15084 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ANKRD28O15084 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ANKRD28O15084 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ANKRD28O15084 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ANKRD28O15084 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ANKRD28O15084 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ANKRD28O15084 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ANKRD28O15084 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ANKRD28O15084 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ANKRD28O15084 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ANKRD28O15084 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ANKRD28O15084 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ANKRD28O15084 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ANKRD28O15084 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ANKRD28O15084 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ANKRD28O15084 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ANKRD28O15084 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ANKRD28O15084 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ANKRD28O15084 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ANKRD28O15084 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ANKRD28O15084 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ANKRD28O15084 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ANKRD28O15084 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ANKRD28O15084 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ANKRD28O15084 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ANKRD28O15084 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ANKRD28O15084 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ANKRD28O15084 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ANKRD28O15084 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ANKRD28O15084 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ANKRD28O15084 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ANKRD28O15084 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ANKRD28O15084 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ANKRD28O15084 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ANKRD28O15084 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ANKRD28O15084 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ANKRD28O15084 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ANKRD28O15084 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ANKRD28O15084 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ANKRD28O15084 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ANKRD28O15084 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ANKRD28O15084 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ANKRD28O15084 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ANKRD28O15084 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ANKRD28O15084 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ANKRD28O15084 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ANKRD28O15084 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ANKRD28O15084 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ANKRD28O15084 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ANKRD28O15084 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ANKRD28O15084 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ANKRD28O15084 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms