Protein–RNA interactions for Protein: O15041

SEMA3E, Semaphorin-3E, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3EO15041 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEMA3EO15041 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEMA3EO15041 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEMA3EO15041 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEMA3EO15041 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEMA3EO15041 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEMA3EO15041 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEMA3EO15041 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEMA3EO15041 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEMA3EO15041 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEMA3EO15041 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEMA3EO15041 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEMA3EO15041 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEMA3EO15041 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEMA3EO15041 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SEMA3EO15041 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEMA3EO15041 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEMA3EO15041 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEMA3EO15041 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEMA3EO15041 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEMA3EO15041 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEMA3EO15041 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEMA3EO15041 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEMA3EO15041 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEMA3EO15041 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SEMA3EO15041 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEMA3EO15041 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEMA3EO15041 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEMA3EO15041 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEMA3EO15041 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEMA3EO15041 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEMA3EO15041 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SEMA3EO15041 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SEMA3EO15041 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEMA3EO15041 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEMA3EO15041 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SEMA3EO15041 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SEMA3EO15041 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEMA3EO15041 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEMA3EO15041 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEMA3EO15041 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEMA3EO15041 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEMA3EO15041 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEMA3EO15041 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEMA3EO15041 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEMA3EO15041 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEMA3EO15041 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEMA3EO15041 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEMA3EO15041 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEMA3EO15041 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEMA3EO15041 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEMA3EO15041 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEMA3EO15041 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEMA3EO15041 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEMA3EO15041 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEMA3EO15041 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEMA3EO15041 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEMA3EO15041 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SEMA3EO15041 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SEMA3EO15041 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SEMA3EO15041 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SEMA3EO15041 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SEMA3EO15041 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SEMA3EO15041 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SEMA3EO15041 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SEMA3EO15041 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SEMA3EO15041 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SEMA3EO15041 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SEMA3EO15041 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SEMA3EO15041 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SEMA3EO15041 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SEMA3EO15041 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
SEMA3EO15041 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SEMA3EO15041 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SEMA3EO15041 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SEMA3EO15041 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SEMA3EO15041 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SEMA3EO15041 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SEMA3EO15041 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEMA3EO15041 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEMA3EO15041 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEMA3EO15041 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEMA3EO15041 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEMA3EO15041 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEMA3EO15041 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEMA3EO15041 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEMA3EO15041 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEMA3EO15041 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEMA3EO15041 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEMA3EO15041 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SEMA3EO15041 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEMA3EO15041 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEMA3EO15041 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEMA3EO15041 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SEMA3EO15041 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEMA3EO15041 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEMA3EO15041 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEMA3EO15041 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEMA3EO15041 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SEMA3EO15041 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms