Protein–RNA interactions for Protein: O00468

AGRN, Agrin, humanhuman

Predictions only

Length 2,067 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGRNO00468 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
AGRNO00468 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
AGRNO00468 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
AGRNO00468 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
AGRNO00468 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
AGRNO00468 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
AGRNO00468 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
AGRNO00468 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
AGRNO00468 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
AGRNO00468 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
AGRNO00468 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
AGRNO00468 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
AGRNO00468 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
AGRNO00468 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.75□□□□□ -0.21
AGRNO00468 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
AGRNO00468 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
AGRNO00468 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
AGRNO00468 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
AGRNO00468 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
AGRNO00468 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
AGRNO00468 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
AGRNO00468 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
AGRNO00468 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
AGRNO00468 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
AGRNO00468 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
AGRNO00468 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
AGRNO00468 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
AGRNO00468 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
AGRNO00468 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
AGRNO00468 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
AGRNO00468 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
AGRNO00468 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
AGRNO00468 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
AGRNO00468 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
AGRNO00468 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
AGRNO00468 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
AGRNO00468 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
AGRNO00468 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
AGRNO00468 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
AGRNO00468 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
AGRNO00468 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
AGRNO00468 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
AGRNO00468 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
AGRNO00468 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
AGRNO00468 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
AGRNO00468 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
AGRNO00468 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
AGRNO00468 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
AGRNO00468 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
AGRNO00468 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
AGRNO00468 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
AGRNO00468 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
AGRNO00468 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
AGRNO00468 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
AGRNO00468 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
AGRNO00468 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
AGRNO00468 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
AGRNO00468 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
AGRNO00468 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
AGRNO00468 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
AGRNO00468 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
AGRNO00468 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
AGRNO00468 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
AGRNO00468 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
AGRNO00468 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
AGRNO00468 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
AGRNO00468 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
AGRNO00468 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
AGRNO00468 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
AGRNO00468 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
AGRNO00468 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
AGRNO00468 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
AGRNO00468 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
AGRNO00468 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
AGRNO00468 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
AGRNO00468 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
AGRNO00468 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
AGRNO00468 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
AGRNO00468 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
AGRNO00468 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
AGRNO00468 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
AGRNO00468 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
AGRNO00468 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
AGRNO00468 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
AGRNO00468 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
AGRNO00468 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
AGRNO00468 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
AGRNO00468 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
AGRNO00468 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
AGRNO00468 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
AGRNO00468 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
AGRNO00468 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
AGRNO00468 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
AGRNO00468 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
AGRNO00468 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
AGRNO00468 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
AGRNO00468 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
AGRNO00468 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
AGRNO00468 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
AGRNO00468 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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