Protein–RNA interactions for Protein: J3KSC0

LINC01387, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01387, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01387J3KSC0 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC01387J3KSC0 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC01387J3KSC0 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC01387J3KSC0 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC01387J3KSC0 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC01387J3KSC0 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC01387J3KSC0 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC01387J3KSC0 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC01387J3KSC0 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC01387J3KSC0 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC01387J3KSC0 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC01387J3KSC0 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC01387J3KSC0 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC01387J3KSC0 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC01387J3KSC0 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC01387J3KSC0 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC01387J3KSC0 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LINC01387J3KSC0 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LINC01387J3KSC0 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
LINC01387J3KSC0 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
LINC01387J3KSC0 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LINC01387J3KSC0 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
LINC01387J3KSC0 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LINC01387J3KSC0 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC01387J3KSC0 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC01387J3KSC0 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC01387J3KSC0 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC01387J3KSC0 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC01387J3KSC0 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC01387J3KSC0 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC01387J3KSC0 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC01387J3KSC0 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC01387J3KSC0 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC01387J3KSC0 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC01387J3KSC0 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC01387J3KSC0 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC01387J3KSC0 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC01387J3KSC0 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC01387J3KSC0 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC01387J3KSC0 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC01387J3KSC0 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC01387J3KSC0 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC01387J3KSC0 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC01387J3KSC0 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC01387J3KSC0 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC01387J3KSC0 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC01387J3KSC0 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC01387J3KSC0 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC01387J3KSC0 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC01387J3KSC0 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LINC01387J3KSC0 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC01387J3KSC0 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC01387J3KSC0 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC01387J3KSC0 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC01387J3KSC0 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC01387J3KSC0 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC01387J3KSC0 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC01387J3KSC0 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC01387J3KSC0 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC01387J3KSC0 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC01387J3KSC0 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC01387J3KSC0 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC01387J3KSC0 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC01387J3KSC0 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC01387J3KSC0 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC01387J3KSC0 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC01387J3KSC0 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC01387J3KSC0 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC01387J3KSC0 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC01387J3KSC0 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC01387J3KSC0 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC01387J3KSC0 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC01387J3KSC0 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC01387J3KSC0 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC01387J3KSC0 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC01387J3KSC0 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC01387J3KSC0 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC01387J3KSC0 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC01387J3KSC0 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LINC01387J3KSC0 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC01387J3KSC0 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC01387J3KSC0 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC01387J3KSC0 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC01387J3KSC0 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC01387J3KSC0 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC01387J3KSC0 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC01387J3KSC0 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC01387J3KSC0 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC01387J3KSC0 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC01387J3KSC0 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC01387J3KSC0 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC01387J3KSC0 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC01387J3KSC0 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC01387J3KSC0 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC01387J3KSC0 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC01387J3KSC0 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC01387J3KSC0 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC01387J3KSC0 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC01387J3KSC0 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LINC01387J3KSC0 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms