Protein–RNA interactions for Protein: H3BVE0

BOLA2-SMG1P6, BOLA2-SMG1P6 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms