Protein–RNA interactions for Protein: F8W1W9

NPIPB9, Nuclear pore complex-interacting protein family member B9, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB9F8W1W9 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NPIPB9F8W1W9 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
NPIPB9F8W1W9 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NPIPB9F8W1W9 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NPIPB9F8W1W9 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NPIPB9F8W1W9 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NPIPB9F8W1W9 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NPIPB9F8W1W9 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
NPIPB9F8W1W9 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
NPIPB9F8W1W9 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NPIPB9F8W1W9 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NPIPB9F8W1W9 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NPIPB9F8W1W9 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NPIPB9F8W1W9 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NPIPB9F8W1W9 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NPIPB9F8W1W9 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NPIPB9F8W1W9 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NPIPB9F8W1W9 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NPIPB9F8W1W9 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NPIPB9F8W1W9 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NPIPB9F8W1W9 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NPIPB9F8W1W9 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NPIPB9F8W1W9 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NPIPB9F8W1W9 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NPIPB9F8W1W9 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NPIPB9F8W1W9 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NPIPB9F8W1W9 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NPIPB9F8W1W9 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NPIPB9F8W1W9 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NPIPB9F8W1W9 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NPIPB9F8W1W9 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NPIPB9F8W1W9 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
NPIPB9F8W1W9 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NPIPB9F8W1W9 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NPIPB9F8W1W9 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
NPIPB9F8W1W9 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NPIPB9F8W1W9 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NPIPB9F8W1W9 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NPIPB9F8W1W9 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NPIPB9F8W1W9 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NPIPB9F8W1W9 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NPIPB9F8W1W9 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NPIPB9F8W1W9 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NPIPB9F8W1W9 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NPIPB9F8W1W9 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
NPIPB9F8W1W9 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NPIPB9F8W1W9 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NPIPB9F8W1W9 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NPIPB9F8W1W9 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NPIPB9F8W1W9 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
NPIPB9F8W1W9 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NPIPB9F8W1W9 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NPIPB9F8W1W9 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NPIPB9F8W1W9 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NPIPB9F8W1W9 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NPIPB9F8W1W9 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NPIPB9F8W1W9 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NPIPB9F8W1W9 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NPIPB9F8W1W9 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NPIPB9F8W1W9 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NPIPB9F8W1W9 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NPIPB9F8W1W9 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NPIPB9F8W1W9 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NPIPB9F8W1W9 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NPIPB9F8W1W9 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NPIPB9F8W1W9 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NPIPB9F8W1W9 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
NPIPB9F8W1W9 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NPIPB9F8W1W9 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NPIPB9F8W1W9 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NPIPB9F8W1W9 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NPIPB9F8W1W9 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NPIPB9F8W1W9 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NPIPB9F8W1W9 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NPIPB9F8W1W9 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NPIPB9F8W1W9 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NPIPB9F8W1W9 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NPIPB9F8W1W9 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NPIPB9F8W1W9 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NPIPB9F8W1W9 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NPIPB9F8W1W9 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NPIPB9F8W1W9 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
NPIPB9F8W1W9 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NPIPB9F8W1W9 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NPIPB9F8W1W9 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NPIPB9F8W1W9 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NPIPB9F8W1W9 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
NPIPB9F8W1W9 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
NPIPB9F8W1W9 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
NPIPB9F8W1W9 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NPIPB9F8W1W9 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NPIPB9F8W1W9 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NPIPB9F8W1W9 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NPIPB9F8W1W9 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NPIPB9F8W1W9 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NPIPB9F8W1W9 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
NPIPB9F8W1W9 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NPIPB9F8W1W9 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NPIPB9F8W1W9 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NPIPB9F8W1W9 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms