Protein–RNA interactions for Protein: B3KS81

SRRM5, Serine/arginine repetitive matrix protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM5B3KS81 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRRM5B3KS81 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRRM5B3KS81 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRRM5B3KS81 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRRM5B3KS81 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SRRM5B3KS81 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SRRM5B3KS81 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SRRM5B3KS81 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SRRM5B3KS81 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SRRM5B3KS81 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SRRM5B3KS81 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SRRM5B3KS81 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SRRM5B3KS81 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SRRM5B3KS81 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SRRM5B3KS81 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SRRM5B3KS81 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SRRM5B3KS81 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SRRM5B3KS81 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SRRM5B3KS81 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SRRM5B3KS81 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SRRM5B3KS81 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SRRM5B3KS81 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SRRM5B3KS81 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SRRM5B3KS81 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SRRM5B3KS81 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SRRM5B3KS81 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SRRM5B3KS81 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SRRM5B3KS81 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SRRM5B3KS81 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SRRM5B3KS81 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SRRM5B3KS81 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SRRM5B3KS81 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SRRM5B3KS81 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SRRM5B3KS81 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SRRM5B3KS81 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SRRM5B3KS81 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SRRM5B3KS81 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SRRM5B3KS81 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SRRM5B3KS81 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SRRM5B3KS81 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SRRM5B3KS81 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SRRM5B3KS81 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SRRM5B3KS81 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SRRM5B3KS81 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SRRM5B3KS81 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SRRM5B3KS81 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SRRM5B3KS81 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SRRM5B3KS81 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SRRM5B3KS81 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SRRM5B3KS81 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SRRM5B3KS81 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SRRM5B3KS81 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SRRM5B3KS81 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SRRM5B3KS81 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SRRM5B3KS81 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SRRM5B3KS81 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SRRM5B3KS81 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SRRM5B3KS81 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SRRM5B3KS81 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SRRM5B3KS81 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SRRM5B3KS81 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SRRM5B3KS81 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SRRM5B3KS81 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SRRM5B3KS81 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SRRM5B3KS81 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SRRM5B3KS81 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SRRM5B3KS81 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SRRM5B3KS81 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SRRM5B3KS81 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SRRM5B3KS81 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SRRM5B3KS81 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SRRM5B3KS81 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SRRM5B3KS81 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SRRM5B3KS81 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SRRM5B3KS81 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SRRM5B3KS81 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRRM5B3KS81 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRRM5B3KS81 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRRM5B3KS81 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRRM5B3KS81 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRRM5B3KS81 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRRM5B3KS81 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRRM5B3KS81 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRRM5B3KS81 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRRM5B3KS81 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRRM5B3KS81 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRRM5B3KS81 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRRM5B3KS81 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRRM5B3KS81 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRRM5B3KS81 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRRM5B3KS81 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRRM5B3KS81 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRRM5B3KS81 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRRM5B3KS81 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRRM5B3KS81 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRRM5B3KS81 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SRRM5B3KS81 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRRM5B3KS81 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRRM5B3KS81 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SRRM5B3KS81 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms