Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HMGB1P1B2RPK0 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HMGB1P1B2RPK0 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HMGB1P1B2RPK0 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
HMGB1P1B2RPK0 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HMGB1P1B2RPK0 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HMGB1P1B2RPK0 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HMGB1P1B2RPK0 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HMGB1P1B2RPK0 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HMGB1P1B2RPK0 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HMGB1P1B2RPK0 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HMGB1P1B2RPK0 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HMGB1P1B2RPK0 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HMGB1P1B2RPK0 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HMGB1P1B2RPK0 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HMGB1P1B2RPK0 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HMGB1P1B2RPK0 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HMGB1P1B2RPK0 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HMGB1P1B2RPK0 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HMGB1P1B2RPK0 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HMGB1P1B2RPK0 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HMGB1P1B2RPK0 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HMGB1P1B2RPK0 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HMGB1P1B2RPK0 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HMGB1P1B2RPK0 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HMGB1P1B2RPK0 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HMGB1P1B2RPK0 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HMGB1P1B2RPK0 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HMGB1P1B2RPK0 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HMGB1P1B2RPK0 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HMGB1P1B2RPK0 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HMGB1P1B2RPK0 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HMGB1P1B2RPK0 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HMGB1P1B2RPK0 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HMGB1P1B2RPK0 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HMGB1P1B2RPK0 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HMGB1P1B2RPK0 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HMGB1P1B2RPK0 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HMGB1P1B2RPK0 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HMGB1P1B2RPK0 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HMGB1P1B2RPK0 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HMGB1P1B2RPK0 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HMGB1P1B2RPK0 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HMGB1P1B2RPK0 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HMGB1P1B2RPK0 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HMGB1P1B2RPK0 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HMGB1P1B2RPK0 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HMGB1P1B2RPK0 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HMGB1P1B2RPK0 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HMGB1P1B2RPK0 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HMGB1P1B2RPK0 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HMGB1P1B2RPK0 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
HMGB1P1B2RPK0 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HMGB1P1B2RPK0 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
HMGB1P1B2RPK0 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HMGB1P1B2RPK0 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HMGB1P1B2RPK0 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HMGB1P1B2RPK0 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HMGB1P1B2RPK0 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HMGB1P1B2RPK0 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HMGB1P1B2RPK0 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
HMGB1P1B2RPK0 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
HMGB1P1B2RPK0 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
HMGB1P1B2RPK0 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HMGB1P1B2RPK0 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HMGB1P1B2RPK0 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HMGB1P1B2RPK0 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HMGB1P1B2RPK0 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HMGB1P1B2RPK0 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HMGB1P1B2RPK0 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HMGB1P1B2RPK0 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HMGB1P1B2RPK0 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HMGB1P1B2RPK0 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HMGB1P1B2RPK0 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HMGB1P1B2RPK0 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HMGB1P1B2RPK0 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HMGB1P1B2RPK0 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HMGB1P1B2RPK0 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HMGB1P1B2RPK0 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HMGB1P1B2RPK0 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HMGB1P1B2RPK0 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HMGB1P1B2RPK0 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HMGB1P1B2RPK0 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HMGB1P1B2RPK0 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HMGB1P1B2RPK0 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
HMGB1P1B2RPK0 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HMGB1P1B2RPK0 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HMGB1P1B2RPK0 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HMGB1P1B2RPK0 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HMGB1P1B2RPK0 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
HMGB1P1B2RPK0 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HMGB1P1B2RPK0 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HMGB1P1B2RPK0 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HMGB1P1B2RPK0 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HMGB1P1B2RPK0 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HMGB1P1B2RPK0 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HMGB1P1B2RPK0 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HMGB1P1B2RPK0 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HMGB1P1B2RPK0 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HMGB1P1B2RPK0 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms