Protein–RNA interactions for Protein: B1AKI9

ISM1, Isthmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ISM1B1AKI9 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ISM1B1AKI9 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ISM1B1AKI9 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ISM1B1AKI9 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ISM1B1AKI9 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ISM1B1AKI9 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ISM1B1AKI9 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ISM1B1AKI9 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ISM1B1AKI9 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ISM1B1AKI9 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ISM1B1AKI9 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ISM1B1AKI9 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ISM1B1AKI9 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ISM1B1AKI9 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ISM1B1AKI9 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ISM1B1AKI9 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ISM1B1AKI9 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ISM1B1AKI9 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ISM1B1AKI9 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ISM1B1AKI9 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ISM1B1AKI9 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ISM1B1AKI9 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ISM1B1AKI9 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ISM1B1AKI9 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ISM1B1AKI9 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ISM1B1AKI9 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ISM1B1AKI9 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ISM1B1AKI9 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ISM1B1AKI9 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ISM1B1AKI9 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ISM1B1AKI9 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ISM1B1AKI9 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ISM1B1AKI9 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ISM1B1AKI9 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ISM1B1AKI9 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ISM1B1AKI9 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ISM1B1AKI9 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ISM1B1AKI9 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ISM1B1AKI9 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ISM1B1AKI9 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ISM1B1AKI9 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ISM1B1AKI9 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ISM1B1AKI9 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ISM1B1AKI9 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ISM1B1AKI9 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ISM1B1AKI9 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ISM1B1AKI9 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ISM1B1AKI9 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ISM1B1AKI9 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ISM1B1AKI9 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ISM1B1AKI9 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ISM1B1AKI9 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ISM1B1AKI9 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ISM1B1AKI9 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ISM1B1AKI9 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ISM1B1AKI9 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ISM1B1AKI9 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ISM1B1AKI9 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ISM1B1AKI9 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ISM1B1AKI9 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ISM1B1AKI9 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ISM1B1AKI9 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ISM1B1AKI9 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ISM1B1AKI9 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ISM1B1AKI9 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ISM1B1AKI9 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ISM1B1AKI9 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ISM1B1AKI9 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ISM1B1AKI9 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ISM1B1AKI9 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ISM1B1AKI9 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ISM1B1AKI9 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ISM1B1AKI9 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ISM1B1AKI9 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ISM1B1AKI9 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ISM1B1AKI9 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ISM1B1AKI9 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ISM1B1AKI9 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ISM1B1AKI9 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ISM1B1AKI9 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ISM1B1AKI9 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ISM1B1AKI9 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ISM1B1AKI9 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ISM1B1AKI9 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ISM1B1AKI9 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ISM1B1AKI9 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ISM1B1AKI9 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ISM1B1AKI9 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ISM1B1AKI9 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ISM1B1AKI9 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ISM1B1AKI9 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ISM1B1AKI9 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ISM1B1AKI9 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ISM1B1AKI9 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ISM1B1AKI9 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ISM1B1AKI9 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ISM1B1AKI9 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ISM1B1AKI9 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ISM1B1AKI9 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ISM1B1AKI9 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.7 ms