Protein–RNA interactions for Protein: A8MV65

VGLL3, Transcription cofactor vestigial-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGLL3A8MV65 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VGLL3A8MV65 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VGLL3A8MV65 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VGLL3A8MV65 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VGLL3A8MV65 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VGLL3A8MV65 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VGLL3A8MV65 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VGLL3A8MV65 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VGLL3A8MV65 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VGLL3A8MV65 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VGLL3A8MV65 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
VGLL3A8MV65 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
VGLL3A8MV65 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
VGLL3A8MV65 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VGLL3A8MV65 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VGLL3A8MV65 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VGLL3A8MV65 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC18■□□□□ 0.47
VGLL3A8MV65 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VGLL3A8MV65 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
VGLL3A8MV65 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VGLL3A8MV65 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VGLL3A8MV65 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VGLL3A8MV65 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VGLL3A8MV65 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
VGLL3A8MV65 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VGLL3A8MV65 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC18■□□□□ 0.47
VGLL3A8MV65 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VGLL3A8MV65 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
VGLL3A8MV65 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VGLL3A8MV65 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
VGLL3A8MV65 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
VGLL3A8MV65 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC18■□□□□ 0.47
VGLL3A8MV65 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
VGLL3A8MV65 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC18■□□□□ 0.47
VGLL3A8MV65 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC18■□□□□ 0.47
VGLL3A8MV65 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VGLL3A8MV65 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
VGLL3A8MV65 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
VGLL3A8MV65 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
VGLL3A8MV65 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VGLL3A8MV65 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
VGLL3A8MV65 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
VGLL3A8MV65 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VGLL3A8MV65 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
VGLL3A8MV65 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
VGLL3A8MV65 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VGLL3A8MV65 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VGLL3A8MV65 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VGLL3A8MV65 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
VGLL3A8MV65 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
VGLL3A8MV65 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VGLL3A8MV65 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VGLL3A8MV65 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VGLL3A8MV65 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VGLL3A8MV65 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VGLL3A8MV65 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VGLL3A8MV65 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VGLL3A8MV65 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VGLL3A8MV65 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VGLL3A8MV65 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VGLL3A8MV65 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VGLL3A8MV65 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VGLL3A8MV65 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VGLL3A8MV65 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VGLL3A8MV65 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VGLL3A8MV65 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VGLL3A8MV65 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VGLL3A8MV65 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VGLL3A8MV65 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
VGLL3A8MV65 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VGLL3A8MV65 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VGLL3A8MV65 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VGLL3A8MV65 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VGLL3A8MV65 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VGLL3A8MV65 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VGLL3A8MV65 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VGLL3A8MV65 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VGLL3A8MV65 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
VGLL3A8MV65 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VGLL3A8MV65 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VGLL3A8MV65 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VGLL3A8MV65 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
VGLL3A8MV65 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VGLL3A8MV65 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VGLL3A8MV65 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VGLL3A8MV65 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VGLL3A8MV65 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VGLL3A8MV65 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VGLL3A8MV65 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VGLL3A8MV65 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VGLL3A8MV65 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VGLL3A8MV65 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VGLL3A8MV65 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
VGLL3A8MV65 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VGLL3A8MV65 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VGLL3A8MV65 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
VGLL3A8MV65 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
VGLL3A8MV65 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VGLL3A8MV65 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
VGLL3A8MV65 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms