Protein–RNA interactions for Protein: A6NMT0

DBX1, Homeobox protein DBX1, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DBX1A6NMT0 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DBX1A6NMT0 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DBX1A6NMT0 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DBX1A6NMT0 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DBX1A6NMT0 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DBX1A6NMT0 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DBX1A6NMT0 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DBX1A6NMT0 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DBX1A6NMT0 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DBX1A6NMT0 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DBX1A6NMT0 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DBX1A6NMT0 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DBX1A6NMT0 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DBX1A6NMT0 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DBX1A6NMT0 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
DBX1A6NMT0 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
DBX1A6NMT0 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
DBX1A6NMT0 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
DBX1A6NMT0 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
DBX1A6NMT0 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
DBX1A6NMT0 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
DBX1A6NMT0 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
DBX1A6NMT0 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
DBX1A6NMT0 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
DBX1A6NMT0 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
DBX1A6NMT0 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DBX1A6NMT0 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DBX1A6NMT0 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DBX1A6NMT0 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DBX1A6NMT0 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DBX1A6NMT0 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DBX1A6NMT0 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DBX1A6NMT0 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DBX1A6NMT0 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DBX1A6NMT0 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DBX1A6NMT0 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
DBX1A6NMT0 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DBX1A6NMT0 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DBX1A6NMT0 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
DBX1A6NMT0 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DBX1A6NMT0 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DBX1A6NMT0 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DBX1A6NMT0 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DBX1A6NMT0 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DBX1A6NMT0 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DBX1A6NMT0 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DBX1A6NMT0 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DBX1A6NMT0 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DBX1A6NMT0 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DBX1A6NMT0 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DBX1A6NMT0 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DBX1A6NMT0 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DBX1A6NMT0 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DBX1A6NMT0 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DBX1A6NMT0 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
DBX1A6NMT0 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
DBX1A6NMT0 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DBX1A6NMT0 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DBX1A6NMT0 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DBX1A6NMT0 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DBX1A6NMT0 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DBX1A6NMT0 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DBX1A6NMT0 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DBX1A6NMT0 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DBX1A6NMT0 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DBX1A6NMT0 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DBX1A6NMT0 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DBX1A6NMT0 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DBX1A6NMT0 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
DBX1A6NMT0 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DBX1A6NMT0 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DBX1A6NMT0 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DBX1A6NMT0 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DBX1A6NMT0 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DBX1A6NMT0 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DBX1A6NMT0 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
DBX1A6NMT0 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DBX1A6NMT0 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DBX1A6NMT0 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DBX1A6NMT0 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DBX1A6NMT0 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DBX1A6NMT0 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DBX1A6NMT0 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DBX1A6NMT0 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
DBX1A6NMT0 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
DBX1A6NMT0 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
DBX1A6NMT0 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DBX1A6NMT0 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DBX1A6NMT0 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DBX1A6NMT0 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
DBX1A6NMT0 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
DBX1A6NMT0 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DBX1A6NMT0 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DBX1A6NMT0 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DBX1A6NMT0 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DBX1A6NMT0 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DBX1A6NMT0 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DBX1A6NMT0 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
DBX1A6NMT0 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
DBX1A6NMT0 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms