Protein–RNA interactions for Protein: A6NCW7

USP17L4, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L4A6NCW7 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP17L4A6NCW7 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP17L4A6NCW7 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
USP17L4A6NCW7 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP17L4A6NCW7 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
USP17L4A6NCW7 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
USP17L4A6NCW7 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
USP17L4A6NCW7 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP17L4A6NCW7 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP17L4A6NCW7 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP17L4A6NCW7 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
USP17L4A6NCW7 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
USP17L4A6NCW7 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
USP17L4A6NCW7 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
USP17L4A6NCW7 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
USP17L4A6NCW7 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
USP17L4A6NCW7 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
USP17L4A6NCW7 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
USP17L4A6NCW7 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
USP17L4A6NCW7 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP17L4A6NCW7 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP17L4A6NCW7 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP17L4A6NCW7 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP17L4A6NCW7 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP17L4A6NCW7 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP17L4A6NCW7 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP17L4A6NCW7 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP17L4A6NCW7 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP17L4A6NCW7 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP17L4A6NCW7 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP17L4A6NCW7 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP17L4A6NCW7 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP17L4A6NCW7 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP17L4A6NCW7 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
USP17L4A6NCW7 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP17L4A6NCW7 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP17L4A6NCW7 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP17L4A6NCW7 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP17L4A6NCW7 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP17L4A6NCW7 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP17L4A6NCW7 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP17L4A6NCW7 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP17L4A6NCW7 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP17L4A6NCW7 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP17L4A6NCW7 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
USP17L4A6NCW7 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP17L4A6NCW7 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
USP17L4A6NCW7 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP17L4A6NCW7 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP17L4A6NCW7 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP17L4A6NCW7 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP17L4A6NCW7 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP17L4A6NCW7 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
USP17L4A6NCW7 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP17L4A6NCW7 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP17L4A6NCW7 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP17L4A6NCW7 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP17L4A6NCW7 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP17L4A6NCW7 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP17L4A6NCW7 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP17L4A6NCW7 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP17L4A6NCW7 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP17L4A6NCW7 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP17L4A6NCW7 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP17L4A6NCW7 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP17L4A6NCW7 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
USP17L4A6NCW7 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP17L4A6NCW7 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP17L4A6NCW7 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP17L4A6NCW7 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP17L4A6NCW7 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP17L4A6NCW7 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP17L4A6NCW7 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP17L4A6NCW7 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
USP17L4A6NCW7 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP17L4A6NCW7 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP17L4A6NCW7 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
USP17L4A6NCW7 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP17L4A6NCW7 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP17L4A6NCW7 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP17L4A6NCW7 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP17L4A6NCW7 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP17L4A6NCW7 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
USP17L4A6NCW7 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP17L4A6NCW7 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
USP17L4A6NCW7 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP17L4A6NCW7 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP17L4A6NCW7 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP17L4A6NCW7 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP17L4A6NCW7 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP17L4A6NCW7 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP17L4A6NCW7 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP17L4A6NCW7 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP17L4A6NCW7 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP17L4A6NCW7 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
USP17L4A6NCW7 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP17L4A6NCW7 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP17L4A6NCW7 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP17L4A6NCW7 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
USP17L4A6NCW7 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms