Protein–RNA interactions for Protein: A5PKW4

PSD, PH and SEC7 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSDA5PKW4 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PSDA5PKW4 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PSDA5PKW4 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PSDA5PKW4 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PSDA5PKW4 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PSDA5PKW4 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PSDA5PKW4 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PSDA5PKW4 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PSDA5PKW4 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PSDA5PKW4 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PSDA5PKW4 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PSDA5PKW4 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PSDA5PKW4 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PSDA5PKW4 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PSDA5PKW4 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PSDA5PKW4 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PSDA5PKW4 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PSDA5PKW4 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PSDA5PKW4 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PSDA5PKW4 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PSDA5PKW4 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PSDA5PKW4 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PSDA5PKW4 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PSDA5PKW4 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PSDA5PKW4 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PSDA5PKW4 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PSDA5PKW4 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PSDA5PKW4 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PSDA5PKW4 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PSDA5PKW4 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PSDA5PKW4 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PSDA5PKW4 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PSDA5PKW4 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PSDA5PKW4 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PSDA5PKW4 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PSDA5PKW4 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PSDA5PKW4 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PSDA5PKW4 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PSDA5PKW4 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PSDA5PKW4 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PSDA5PKW4 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PSDA5PKW4 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PSDA5PKW4 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PSDA5PKW4 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PSDA5PKW4 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PSDA5PKW4 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PSDA5PKW4 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PSDA5PKW4 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PSDA5PKW4 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PSDA5PKW4 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PSDA5PKW4 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PSDA5PKW4 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PSDA5PKW4 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PSDA5PKW4 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PSDA5PKW4 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PSDA5PKW4 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PSDA5PKW4 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PSDA5PKW4 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PSDA5PKW4 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PSDA5PKW4 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PSDA5PKW4 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PSDA5PKW4 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PSDA5PKW4 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PSDA5PKW4 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PSDA5PKW4 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PSDA5PKW4 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PSDA5PKW4 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PSDA5PKW4 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PSDA5PKW4 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PSDA5PKW4 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PSDA5PKW4 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PSDA5PKW4 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PSDA5PKW4 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PSDA5PKW4 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PSDA5PKW4 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PSDA5PKW4 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PSDA5PKW4 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PSDA5PKW4 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PSDA5PKW4 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PSDA5PKW4 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PSDA5PKW4 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PSDA5PKW4 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PSDA5PKW4 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PSDA5PKW4 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PSDA5PKW4 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PSDA5PKW4 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PSDA5PKW4 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PSDA5PKW4 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PSDA5PKW4 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PSDA5PKW4 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PSDA5PKW4 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PSDA5PKW4 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PSDA5PKW4 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PSDA5PKW4 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PSDA5PKW4 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PSDA5PKW4 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PSDA5PKW4 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PSDA5PKW4 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PSDA5PKW4 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PSDA5PKW4 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms