Protein–RNA interactions for Protein: A4FU69

EFCAB5, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFCAB5A4FU69 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC28.78■■■□□ 2.2
EFCAB5A4FU69 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
EFCAB5A4FU69 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
EFCAB5A4FU69 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
EFCAB5A4FU69 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
EFCAB5A4FU69 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
EFCAB5A4FU69 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
EFCAB5A4FU69 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
EFCAB5A4FU69 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
EFCAB5A4FU69 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
EFCAB5A4FU69 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
EFCAB5A4FU69 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
EFCAB5A4FU69 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
EFCAB5A4FU69 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
EFCAB5A4FU69 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
EFCAB5A4FU69 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
EFCAB5A4FU69 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
EFCAB5A4FU69 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
EFCAB5A4FU69 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
EFCAB5A4FU69 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
EFCAB5A4FU69 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
EFCAB5A4FU69 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
EFCAB5A4FU69 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.2
EFCAB5A4FU69 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
EFCAB5A4FU69 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
EFCAB5A4FU69 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC28.76■■■□□ 2.2
EFCAB5A4FU69 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
EFCAB5A4FU69 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
EFCAB5A4FU69 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
EFCAB5A4FU69 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
EFCAB5A4FU69 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
EFCAB5A4FU69 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
EFCAB5A4FU69 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
EFCAB5A4FU69 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
EFCAB5A4FU69 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
EFCAB5A4FU69 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
EFCAB5A4FU69 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
EFCAB5A4FU69 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
EFCAB5A4FU69 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
EFCAB5A4FU69 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
EFCAB5A4FU69 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
EFCAB5A4FU69 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
EFCAB5A4FU69 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
EFCAB5A4FU69 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
EFCAB5A4FU69 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
EFCAB5A4FU69 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
EFCAB5A4FU69 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
EFCAB5A4FU69 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
EFCAB5A4FU69 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC28.75■■■□□ 2.19
EFCAB5A4FU69 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
EFCAB5A4FU69 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
EFCAB5A4FU69 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
EFCAB5A4FU69 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
EFCAB5A4FU69 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
EFCAB5A4FU69 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
EFCAB5A4FU69 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
EFCAB5A4FU69 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
EFCAB5A4FU69 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
EFCAB5A4FU69 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
EFCAB5A4FU69 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
EFCAB5A4FU69 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
EFCAB5A4FU69 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
EFCAB5A4FU69 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
EFCAB5A4FU69 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
EFCAB5A4FU69 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
EFCAB5A4FU69 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
EFCAB5A4FU69 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
EFCAB5A4FU69 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
EFCAB5A4FU69 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
EFCAB5A4FU69 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
EFCAB5A4FU69 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
EFCAB5A4FU69 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
EFCAB5A4FU69 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
EFCAB5A4FU69 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
EFCAB5A4FU69 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
EFCAB5A4FU69 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.74■■■□□ 2.19
EFCAB5A4FU69 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
EFCAB5A4FU69 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
EFCAB5A4FU69 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
EFCAB5A4FU69 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
EFCAB5A4FU69 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
EFCAB5A4FU69 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC28.74■■■□□ 2.19
EFCAB5A4FU69 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
EFCAB5A4FU69 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
EFCAB5A4FU69 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
EFCAB5A4FU69 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
EFCAB5A4FU69 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
EFCAB5A4FU69 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
EFCAB5A4FU69 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
EFCAB5A4FU69 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
EFCAB5A4FU69 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
EFCAB5A4FU69 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
EFCAB5A4FU69 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
EFCAB5A4FU69 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
EFCAB5A4FU69 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
EFCAB5A4FU69 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
EFCAB5A4FU69 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
EFCAB5A4FU69 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
EFCAB5A4FU69 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
EFCAB5A4FU69 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms