Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X2

SNX8, Sorting nexin-8, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX8Q9Y5X2 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNX8Q9Y5X2 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNX8Q9Y5X2 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNX8Q9Y5X2 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNX8Q9Y5X2 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNX8Q9Y5X2 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SNX8Q9Y5X2 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNX8Q9Y5X2 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNX8Q9Y5X2 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNX8Q9Y5X2 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNX8Q9Y5X2 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNX8Q9Y5X2 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SNX8Q9Y5X2 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNX8Q9Y5X2 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNX8Q9Y5X2 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNX8Q9Y5X2 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNX8Q9Y5X2 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNX8Q9Y5X2 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNX8Q9Y5X2 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNX8Q9Y5X2 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNX8Q9Y5X2 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNX8Q9Y5X2 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNX8Q9Y5X2 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNX8Q9Y5X2 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNX8Q9Y5X2 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNX8Q9Y5X2 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNX8Q9Y5X2 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNX8Q9Y5X2 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNX8Q9Y5X2 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNX8Q9Y5X2 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNX8Q9Y5X2 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNX8Q9Y5X2 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNX8Q9Y5X2 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SNX8Q9Y5X2 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNX8Q9Y5X2 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SNX8Q9Y5X2 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNX8Q9Y5X2 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNX8Q9Y5X2 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SNX8Q9Y5X2 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNX8Q9Y5X2 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNX8Q9Y5X2 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNX8Q9Y5X2 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNX8Q9Y5X2 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SNX8Q9Y5X2 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SNX8Q9Y5X2 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SNX8Q9Y5X2 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SNX8Q9Y5X2 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SNX8Q9Y5X2 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SNX8Q9Y5X2 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SNX8Q9Y5X2 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNX8Q9Y5X2 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNX8Q9Y5X2 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNX8Q9Y5X2 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNX8Q9Y5X2 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNX8Q9Y5X2 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNX8Q9Y5X2 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNX8Q9Y5X2 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNX8Q9Y5X2 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNX8Q9Y5X2 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNX8Q9Y5X2 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNX8Q9Y5X2 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNX8Q9Y5X2 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNX8Q9Y5X2 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNX8Q9Y5X2 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNX8Q9Y5X2 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNX8Q9Y5X2 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNX8Q9Y5X2 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNX8Q9Y5X2 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNX8Q9Y5X2 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNX8Q9Y5X2 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNX8Q9Y5X2 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNX8Q9Y5X2 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNX8Q9Y5X2 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNX8Q9Y5X2 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SNX8Q9Y5X2 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNX8Q9Y5X2 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNX8Q9Y5X2 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNX8Q9Y5X2 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNX8Q9Y5X2 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNX8Q9Y5X2 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNX8Q9Y5X2 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNX8Q9Y5X2 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNX8Q9Y5X2 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNX8Q9Y5X2 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNX8Q9Y5X2 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNX8Q9Y5X2 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNX8Q9Y5X2 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SNX8Q9Y5X2 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNX8Q9Y5X2 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNX8Q9Y5X2 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNX8Q9Y5X2 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNX8Q9Y5X2 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SNX8Q9Y5X2 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SNX8Q9Y5X2 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNX8Q9Y5X2 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNX8Q9Y5X2 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNX8Q9Y5X2 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNX8Q9Y5X2 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNX8Q9Y5X2 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SNX8Q9Y5X2 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms