Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5E7

PCDHB2, Protocadherin beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB2Q9Y5E7 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PCDHB2Q9Y5E7 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PCDHB2Q9Y5E7 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PCDHB2Q9Y5E7 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PCDHB2Q9Y5E7 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PCDHB2Q9Y5E7 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PCDHB2Q9Y5E7 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
PCDHB2Q9Y5E7 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PCDHB2Q9Y5E7 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PCDHB2Q9Y5E7 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PCDHB2Q9Y5E7 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PCDHB2Q9Y5E7 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PCDHB2Q9Y5E7 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PCDHB2Q9Y5E7 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PCDHB2Q9Y5E7 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PCDHB2Q9Y5E7 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PCDHB2Q9Y5E7 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PCDHB2Q9Y5E7 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PCDHB2Q9Y5E7 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PCDHB2Q9Y5E7 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PCDHB2Q9Y5E7 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PCDHB2Q9Y5E7 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PCDHB2Q9Y5E7 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PCDHB2Q9Y5E7 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PCDHB2Q9Y5E7 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PCDHB2Q9Y5E7 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PCDHB2Q9Y5E7 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PCDHB2Q9Y5E7 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PCDHB2Q9Y5E7 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PCDHB2Q9Y5E7 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
PCDHB2Q9Y5E7 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PCDHB2Q9Y5E7 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PCDHB2Q9Y5E7 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PCDHB2Q9Y5E7 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PCDHB2Q9Y5E7 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PCDHB2Q9Y5E7 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PCDHB2Q9Y5E7 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PCDHB2Q9Y5E7 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PCDHB2Q9Y5E7 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PCDHB2Q9Y5E7 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PCDHB2Q9Y5E7 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PCDHB2Q9Y5E7 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PCDHB2Q9Y5E7 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PCDHB2Q9Y5E7 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PCDHB2Q9Y5E7 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PCDHB2Q9Y5E7 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PCDHB2Q9Y5E7 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PCDHB2Q9Y5E7 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PCDHB2Q9Y5E7 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PCDHB2Q9Y5E7 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PCDHB2Q9Y5E7 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PCDHB2Q9Y5E7 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PCDHB2Q9Y5E7 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PCDHB2Q9Y5E7 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PCDHB2Q9Y5E7 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PCDHB2Q9Y5E7 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PCDHB2Q9Y5E7 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PCDHB2Q9Y5E7 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PCDHB2Q9Y5E7 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PCDHB2Q9Y5E7 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PCDHB2Q9Y5E7 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PCDHB2Q9Y5E7 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PCDHB2Q9Y5E7 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PCDHB2Q9Y5E7 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PCDHB2Q9Y5E7 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PCDHB2Q9Y5E7 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PCDHB2Q9Y5E7 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PCDHB2Q9Y5E7 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PCDHB2Q9Y5E7 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PCDHB2Q9Y5E7 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PCDHB2Q9Y5E7 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PCDHB2Q9Y5E7 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PCDHB2Q9Y5E7 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PCDHB2Q9Y5E7 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PCDHB2Q9Y5E7 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PCDHB2Q9Y5E7 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PCDHB2Q9Y5E7 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PCDHB2Q9Y5E7 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PCDHB2Q9Y5E7 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PCDHB2Q9Y5E7 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PCDHB2Q9Y5E7 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PCDHB2Q9Y5E7 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
PCDHB2Q9Y5E7 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PCDHB2Q9Y5E7 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PCDHB2Q9Y5E7 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PCDHB2Q9Y5E7 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PCDHB2Q9Y5E7 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PCDHB2Q9Y5E7 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PCDHB2Q9Y5E7 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PCDHB2Q9Y5E7 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PCDHB2Q9Y5E7 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PCDHB2Q9Y5E7 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PCDHB2Q9Y5E7 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PCDHB2Q9Y5E7 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PCDHB2Q9Y5E7 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PCDHB2Q9Y5E7 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PCDHB2Q9Y5E7 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PCDHB2Q9Y5E7 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PCDHB2Q9Y5E7 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PCDHB2Q9Y5E7 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms