Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4X4

KLF12, Krueppel-like factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF12Q9Y4X4 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
KLF12Q9Y4X4 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
KLF12Q9Y4X4 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
KLF12Q9Y4X4 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
KLF12Q9Y4X4 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
KLF12Q9Y4X4 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
KLF12Q9Y4X4 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
KLF12Q9Y4X4 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
KLF12Q9Y4X4 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
KLF12Q9Y4X4 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
KLF12Q9Y4X4 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
KLF12Q9Y4X4 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
KLF12Q9Y4X4 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
KLF12Q9Y4X4 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
KLF12Q9Y4X4 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
KLF12Q9Y4X4 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
KLF12Q9Y4X4 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
KLF12Q9Y4X4 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
KLF12Q9Y4X4 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
KLF12Q9Y4X4 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
KLF12Q9Y4X4 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
KLF12Q9Y4X4 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
KLF12Q9Y4X4 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
KLF12Q9Y4X4 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
KLF12Q9Y4X4 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
KLF12Q9Y4X4 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
KLF12Q9Y4X4 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
KLF12Q9Y4X4 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
KLF12Q9Y4X4 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
KLF12Q9Y4X4 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
KLF12Q9Y4X4 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
KLF12Q9Y4X4 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
KLF12Q9Y4X4 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
KLF12Q9Y4X4 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
KLF12Q9Y4X4 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
KLF12Q9Y4X4 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
KLF12Q9Y4X4 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
KLF12Q9Y4X4 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
KLF12Q9Y4X4 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
KLF12Q9Y4X4 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
KLF12Q9Y4X4 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
KLF12Q9Y4X4 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
KLF12Q9Y4X4 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
KLF12Q9Y4X4 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
KLF12Q9Y4X4 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
KLF12Q9Y4X4 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
KLF12Q9Y4X4 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
KLF12Q9Y4X4 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
KLF12Q9Y4X4 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
KLF12Q9Y4X4 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
KLF12Q9Y4X4 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
KLF12Q9Y4X4 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
KLF12Q9Y4X4 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
KLF12Q9Y4X4 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
KLF12Q9Y4X4 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
KLF12Q9Y4X4 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
KLF12Q9Y4X4 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
KLF12Q9Y4X4 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
KLF12Q9Y4X4 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
KLF12Q9Y4X4 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
KLF12Q9Y4X4 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
KLF12Q9Y4X4 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
KLF12Q9Y4X4 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
KLF12Q9Y4X4 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
KLF12Q9Y4X4 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
KLF12Q9Y4X4 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.98□□□□□ -0.17
KLF12Q9Y4X4 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
KLF12Q9Y4X4 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
KLF12Q9Y4X4 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
KLF12Q9Y4X4 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
KLF12Q9Y4X4 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
KLF12Q9Y4X4 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
KLF12Q9Y4X4 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
KLF12Q9Y4X4 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
KLF12Q9Y4X4 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
KLF12Q9Y4X4 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
KLF12Q9Y4X4 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
KLF12Q9Y4X4 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
KLF12Q9Y4X4 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
KLF12Q9Y4X4 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
KLF12Q9Y4X4 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
KLF12Q9Y4X4 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
KLF12Q9Y4X4 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
KLF12Q9Y4X4 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
KLF12Q9Y4X4 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
KLF12Q9Y4X4 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
KLF12Q9Y4X4 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
KLF12Q9Y4X4 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
KLF12Q9Y4X4 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
KLF12Q9Y4X4 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
KLF12Q9Y4X4 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
KLF12Q9Y4X4 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
KLF12Q9Y4X4 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
KLF12Q9Y4X4 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
KLF12Q9Y4X4 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
KLF12Q9Y4X4 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
KLF12Q9Y4X4 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
KLF12Q9Y4X4 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
KLF12Q9Y4X4 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
KLF12Q9Y4X4 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms