Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3A2

UTP11, Probable U3 small nucleolar RNA-associated protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP11Q9Y3A2 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
UTP11Q9Y3A2 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
UTP11Q9Y3A2 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
UTP11Q9Y3A2 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
UTP11Q9Y3A2 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
UTP11Q9Y3A2 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
UTP11Q9Y3A2 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
UTP11Q9Y3A2 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
UTP11Q9Y3A2 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
UTP11Q9Y3A2 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
UTP11Q9Y3A2 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
UTP11Q9Y3A2 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
UTP11Q9Y3A2 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
UTP11Q9Y3A2 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
UTP11Q9Y3A2 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
UTP11Q9Y3A2 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
UTP11Q9Y3A2 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
UTP11Q9Y3A2 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
UTP11Q9Y3A2 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
UTP11Q9Y3A2 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
UTP11Q9Y3A2 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
UTP11Q9Y3A2 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
UTP11Q9Y3A2 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
UTP11Q9Y3A2 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
UTP11Q9Y3A2 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
UTP11Q9Y3A2 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
UTP11Q9Y3A2 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
UTP11Q9Y3A2 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
UTP11Q9Y3A2 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
UTP11Q9Y3A2 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
UTP11Q9Y3A2 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
UTP11Q9Y3A2 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
UTP11Q9Y3A2 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
UTP11Q9Y3A2 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
UTP11Q9Y3A2 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
UTP11Q9Y3A2 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
UTP11Q9Y3A2 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
UTP11Q9Y3A2 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
UTP11Q9Y3A2 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
UTP11Q9Y3A2 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
UTP11Q9Y3A2 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
UTP11Q9Y3A2 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
UTP11Q9Y3A2 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
UTP11Q9Y3A2 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
UTP11Q9Y3A2 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
UTP11Q9Y3A2 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
UTP11Q9Y3A2 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
UTP11Q9Y3A2 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
UTP11Q9Y3A2 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
UTP11Q9Y3A2 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
UTP11Q9Y3A2 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
UTP11Q9Y3A2 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
UTP11Q9Y3A2 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
UTP11Q9Y3A2 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
UTP11Q9Y3A2 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
UTP11Q9Y3A2 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
UTP11Q9Y3A2 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
UTP11Q9Y3A2 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
UTP11Q9Y3A2 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
UTP11Q9Y3A2 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
UTP11Q9Y3A2 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
UTP11Q9Y3A2 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
UTP11Q9Y3A2 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
UTP11Q9Y3A2 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
UTP11Q9Y3A2 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
UTP11Q9Y3A2 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
UTP11Q9Y3A2 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
UTP11Q9Y3A2 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
UTP11Q9Y3A2 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
UTP11Q9Y3A2 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
UTP11Q9Y3A2 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
UTP11Q9Y3A2 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
UTP11Q9Y3A2 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
UTP11Q9Y3A2 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
UTP11Q9Y3A2 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
UTP11Q9Y3A2 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
UTP11Q9Y3A2 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
UTP11Q9Y3A2 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
UTP11Q9Y3A2 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
UTP11Q9Y3A2 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
UTP11Q9Y3A2 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
UTP11Q9Y3A2 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
UTP11Q9Y3A2 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
UTP11Q9Y3A2 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
UTP11Q9Y3A2 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
UTP11Q9Y3A2 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
UTP11Q9Y3A2 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
UTP11Q9Y3A2 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
UTP11Q9Y3A2 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
UTP11Q9Y3A2 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
UTP11Q9Y3A2 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
UTP11Q9Y3A2 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
UTP11Q9Y3A2 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
UTP11Q9Y3A2 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
UTP11Q9Y3A2 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
UTP11Q9Y3A2 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
UTP11Q9Y3A2 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
UTP11Q9Y3A2 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
UTP11Q9Y3A2 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
UTP11Q9Y3A2 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms