Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQP3

TNN, Tenascin-N, humanhuman

Predictions only

Length 1,299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNQ9UQP3 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNNQ9UQP3 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNNQ9UQP3 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNNQ9UQP3 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNNQ9UQP3 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNNQ9UQP3 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNNQ9UQP3 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TNNQ9UQP3 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNNQ9UQP3 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNNQ9UQP3 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNNQ9UQP3 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNNQ9UQP3 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TNNQ9UQP3 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TNNQ9UQP3 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TNNQ9UQP3 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TNNQ9UQP3 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TNNQ9UQP3 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TNNQ9UQP3 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TNNQ9UQP3 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TNNQ9UQP3 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TNNQ9UQP3 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TNNQ9UQP3 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TNNQ9UQP3 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TNNQ9UQP3 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TNNQ9UQP3 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TNNQ9UQP3 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TNNQ9UQP3 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TNNQ9UQP3 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TNNQ9UQP3 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TNNQ9UQP3 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TNNQ9UQP3 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TNNQ9UQP3 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TNNQ9UQP3 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TNNQ9UQP3 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TNNQ9UQP3 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TNNQ9UQP3 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TNNQ9UQP3 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TNNQ9UQP3 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TNNQ9UQP3 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TNNQ9UQP3 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TNNQ9UQP3 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TNNQ9UQP3 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TNNQ9UQP3 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TNNQ9UQP3 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TNNQ9UQP3 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TNNQ9UQP3 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TNNQ9UQP3 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TNNQ9UQP3 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TNNQ9UQP3 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TNNQ9UQP3 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TNNQ9UQP3 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TNNQ9UQP3 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TNNQ9UQP3 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TNNQ9UQP3 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TNNQ9UQP3 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TNNQ9UQP3 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TNNQ9UQP3 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TNNQ9UQP3 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TNNQ9UQP3 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TNNQ9UQP3 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TNNQ9UQP3 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TNNQ9UQP3 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TNNQ9UQP3 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TNNQ9UQP3 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TNNQ9UQP3 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TNNQ9UQP3 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TNNQ9UQP3 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TNNQ9UQP3 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TNNQ9UQP3 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TNNQ9UQP3 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TNNQ9UQP3 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TNNQ9UQP3 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TNNQ9UQP3 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TNNQ9UQP3 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TNNQ9UQP3 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TNNQ9UQP3 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TNNQ9UQP3 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TNNQ9UQP3 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TNNQ9UQP3 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TNNQ9UQP3 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TNNQ9UQP3 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TNNQ9UQP3 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TNNQ9UQP3 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
TNNQ9UQP3 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TNNQ9UQP3 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TNNQ9UQP3 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TNNQ9UQP3 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TNNQ9UQP3 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TNNQ9UQP3 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TNNQ9UQP3 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
TNNQ9UQP3 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TNNQ9UQP3 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TNNQ9UQP3 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TNNQ9UQP3 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TNNQ9UQP3 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TNNQ9UQP3 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TNNQ9UQP3 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TNNQ9UQP3 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TNNQ9UQP3 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TNNQ9UQP3 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms